استخدام المتصفحات الالكترونية الخاصة بجينوم الفقريات للتنبؤ بنتائج التحاليل الجزيئية مسبقا لتحديد التراكيب الوراثية لأبقار الهولشتاين و مقارنتها مع نتائج تقنيتي Pcr-Rflp و Sequencing

العناوين الأخرى

The use of electronic browsers for vertebrate genome as a scientific basis for predicting the results of molecular analyzes in advance to determine the genotypes of the holstein cows and comparing them with the results of the pcr-rflp and sequencing techniques

المؤلفون المشاركون

الجنابي، حميد زراق عباس
الأنباري، نصر نوري خضير

المصدر

مجلة زراعة الرافدين

الناشر

جامعة الموصل كلية الزراعة و الغابات

تاريخ النشر

2019-12-31

دولة النشر

العراق

عدد الصفحات

20

التخصصات الرئيسية

الأحياء

الموضوعات

• علم الوراثة
• المستضدات
• الجينوم
• المتصفحات(برامج الحاسوب)

الملخص العربي

هدفت الدراسة الى استخدام المتصفحات الالكترونية الخاصة بجينوم الفقريات كطريقة جديدة و أساس علمي للتنبؤ بنتائج التحاليل الجزيئية مسبقا و المتمثلة بتحديد التراكيب الوراثية لمواقع الجينات المدروسة (Leptin و Leptin-R و FABP3) لابقار الهولشتاين على نسخة DNA أو نسخة cDNA و مقارنتها مع نتائج تقنيتي PCR-RFLP و Sequencing و الدراسات السابقة لغرض الوصول الى افضل و ادق طريقة انتخاب للحيوانات المتميزة بأدائها الانتاجي و التناسلي، استخدمت في هذه الدراسة 50 بقرة هولشتاين، بهدف فصل المادة الوراثية و تحديد التراكيب الوراثية لمواقع الجينات المدروسة، إذ تبين وجود تركيبين وراثيين للـ SNP ((rs29004501 المدروسة لجين اللبتين في عينة الأبقار المدروسة (AA وAB)، و كذلك تركيبين وراثيين للـ SNP ((rs133672995 المدروسة لجين مستقبل اللبتين (CC وCT)، أما لجين FABP3 فقد تبين وجود ثلاثة تراكيب وراثية للـ SNP (rs210042291) وهي (GG وGA وAA)، و تركيبين وراثيين للـ SNP (rs383276104) و هي (GG وGT) مع غياب الـ SNPs (rs136297772 و rs132781540) في عينة الأبقار المدروسة.

و تبين بإمكانية الحصول على جميع المعلومات و التفاصيل الخاصة بقطعة الجينات المدروسة و التنبؤ بالنتائج قبل البدء بالعمل المختبري و مقارنتها مع نتائج تقنيتي PCR-RFLP و Sequencing و الدراسات السابقة، فضلا عن أمكانية اختيار و ترشيح الجينات للدراسة المقترحة من خلال الاعتماد على البيانات المتوفرة في بنك الجينات من خلال استخدام المتصفحات الالكترونية الخاصة بجينوم الفقرياتNational Center for Biotechnology Information (NCBI) وUniversity of California Santa Cruz (UCSC) و Ensembl Genome Browser و هي أفضل طريقة بحثية تدعم بحوث و دراسات الإنتاج الحيواني و استراتيجياته المستقبلية في مجال الوراثة الجزئية، و كذلك تدعم طريقة التربية الانتقائية المستخدمة من قبل المربين لتحسين الماشية، إذ تمكننا من معرفة العدد و النسب المئوية للتراكيب الوراثية و التكرر الاليلي لمواقع الجينات المدروسة بطريقة صحيحة و دقيقة.

الملخص الإنجليزي

The aim of the study is to use the electronic browsers of vertebrate genome as a new method and scientific basis for predicting the results of molecular analyzes in advance represented by determination of genotypes of the studied genes sites (Leptin and Leptin-R and FABB3) for the Holstein cows on DNA copy or cDNA version and comparing them with the results of the PCR-RFLP and sequencing techniques and previous studies to reach the best and most accurate way to selection animals with distinctive productive traits, in this study 50 Holstein cows were used, in order to separate the DNA and determine the genotypes of the studied gene sites, two genotypes of SNP (rs29004501) studied for leptin gene were found in the studied cow sample (AA and AB), as well as two genotypes of SNP (rs133672995) studied of leptin receptor gene (CC and CT), the FABP3 gene showed three genotypes of SNP (GG, GA and AA), and two SNP (rs383276104) genotypes (GG and GT) with the absence of SNPs (rs136297772 and rs132781540) in the studied cows sample.

It is possible to obtain all the information and details of the studied genes fragmentto predict the results before starting laboratory work and compare them with the results of the PCR-RFLP and sequencing techniques and previous studies, as well as the possibility of selection and nomination of genes proposed study by relying on the available data in the gene bank through the use of electronic browsers for genome Vertebrates (National Center for Biotechnology Information (NCBI), the University of California Santa Cruz (UCSC) and the Ensembl Genome Browser), it is the best research method to support research and studies of animal production and future strategies in the field of molecular genetics, and also supports the selective breeding method used by breeders to improve the productive traits of livestock, it enables us to know the number and percentage of genotypes and and allele frequency for the studied genes sites correctly and accurately.

نوع البيانات

أوراق مؤتمرات

رقم السجل

BIM-1098287

• APA
• MLA
• AMA