Bioinformatic Evaluation of Transcriptional Regulation of WNT Pathway Genes with reference to Diabetic Nephropathy
المؤلفون المشاركون
McKay, Gareth
Kavanagh, David H.
Crean, John K.
Maxwell, Alexander P.
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-11-30
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Objective.
WNT/β-catenin pathway members have been implicated in interstitial fibrosis and glomerular sclerosis disease processes characteristic of diabetic nephropathy (DN), processes partly controlled by transcription factors (TFs) that bind to gene promoter regions attenuating regulation.
We sought to identify predicted cis-acting transcription factor binding sites (TFBSs) overrepresented within WNT pathway members.
Methods.
We assessed 62 TFBS motif frequencies from the JASPAR databases in 65 WNT pathway genes.
P values were estimated on the hypergeometric distribution for each TF.
Gene expression profiles of enriched motifs were examined in DN-related datasets to assess clinical significance.
Results.
Transcription factor AP-2 alpha (TFAP2A), myeloid zinc finger 1 (MZF1), and specificity protein 1 (SP1) were significantly enriched within WNT pathway genes ( P values < 6.83 × 10−29, 1.34 × 10−11, and 3.01 × 10−6, resp.).
MZF1 expression was significantly increased in DN in a whole kidney dataset (fold change = 1.16; 16% increase; P = 0.03 ).
TFAP2A expression was decreased in an independent dataset (fold change = −1.02; P = 0.03 ).
No differential expression of SP1 was detected.
Conclusions.
Three TFBS profiles are significantly enriched within WNT pathway genes highlighting the potential of in silico analyses for identification of pathway regulators.
Modification of TF binding may possibly limit DN progression, offering potential therapeutic benefit.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
McKay, Gareth& Kavanagh, David H.& Crean, John K.& Maxwell, Alexander P.. 2015. Bioinformatic Evaluation of Transcriptional Regulation of WNT Pathway Genes with reference to Diabetic Nephropathy. Journal of Diabetes Research،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1108250
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
McKay, Gareth…[et al.]. Bioinformatic Evaluation of Transcriptional Regulation of WNT Pathway Genes with reference to Diabetic Nephropathy. Journal of Diabetes Research No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1108250
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
McKay, Gareth& Kavanagh, David H.& Crean, John K.& Maxwell, Alexander P.. Bioinformatic Evaluation of Transcriptional Regulation of WNT Pathway Genes with reference to Diabetic Nephropathy. Journal of Diabetes Research. 2015. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1108250
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1108250
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر