التنبؤ بقابلية توليد الحساسية لسموم Cry المنتجة من البكتريا Bacillus thuringiensis باستعمال وسائل المعلوماتية الحيوية

الملخص AR

توفر المعلوماتية الحيوية الكثير من الوسائل للدراسات الحيوية و منها دراسة قابلية على توليد الحساسية.

استعمل في الدراسة الحالية وسائل المعلوماتية الحيوية للبحث عن قابلية السموم Cry المنتجة من بكتيريا Bacillus thuringiensis و المستعملة جيناتها في هندسة النباتات لمقاومة الحشرات على توليد الحساسية.

تم الحصول على 513 توالي لبروتينات Cry مختلفة من موقع NCBI مسجلة بشكل رسمي.

أخضعت البروتينات لعدة برامج حاسوب لدراسة بعض المواصفات منها عدد الحوامض الامينية، الوزن الجزيئي و PI و صافي الشحنة على البروتين و قابلية هضم البروتينات بالببسين عند رقم هيدروجين Ph (1.2 و > 2.0).

و كذلك حساب كراهية البروتينات للماء ثم أخضعت لبرنامج حدس الحساسية مثل AllermatchTM المستعمل من قبل المنظمات المختصة FAO/WHO.

أوضحت النتائج اختلاف البروتينات في عدد الحوامض الامينية المكونة لها و التي تمتد من 78 حامض أميني (وزن جزيئي 8587.42 دالتون) إلى بروتين يحوي على 1825 حامض أميني (وزن جزيئي 251932 دالتون) و تراوحت pI بين 4.36 إلى 10.16 و كانت العلاقة طردية بين pI و صافي شحنة البروتين.

أشارت برامج التنبؤ بالحساسية مثل AllermatchTM (المعتمد من قبل منظمة الصحة العالمية) إلى أن 0.78 % (4 من 513) من البروتينات تحوي على حواتم مشابه للمحسسات الموثقة التي ترتبط إلى IgE في حين كان المؤشر الآخر و هو تشابه أكثر من البروتينات تشابه المحسسات.

أما استعمال موقع AllergenOline الذي يختلف قليلا عن البرنامج أعلاه فلم يسجل أي تشابه مع المحسسات و كذلك استعمال البرنامج AlgPred المتخصص بالبحث عن الحواتم التي ترتبط إلى IgE فقد أعطيت نتائج سالبة أيضا.