التوصيف الجزيئي لبعض العزلات السورية من فيروس موازييك البندورة الطماطم (ToMV)‎

الملخص AR

اختبرت 6 عزلات سورية من فيروس موزاييك البندورة / الطماطم Tomato mosaic virus (ToMV، جنس Tobamovirus، عائلة Virgaviridae) بوساطة اختبار التفاعل المتسلسل للبوليميراز بعد النسخ العكسي (RT-PCR) و باستخدام زوج من البادئات المتخصصة بالفيروس، يهدف توصيف هذه العزلات و دراسة الإختلافات الوراثية فيما بينها، و مقارنتها مع عزلات من بلدان أخرى.

أثبتت النتائج إمكانية إكثار قطعة من مورثة أنزيم تضاعف الـRNA للفيروس بطول 459 زوج قاعدي.

كما أوضحت نتائج تحليل التتابع النكليوتيدي لسلاسل الـ cDNA للعزلات المتبخرة من الفيروس تشابهها بنسبة 99.56-100 %، بينما تراوحت نسب التماثل بينها على مستوى الأحماض الأمينية ما بين 99.33 و 100 %.

أظهرت شجرة القرابة الوراثية تماثلا كبيرا للعزلات السورية من فيروس ToMV مع العزلات الآسيوية و مع عزلة واحدة من أستراليا بصورة خاصة، و تراوحت نسب التماثل ما بين 98 و 99 %.

لم تظهر العزلات السورية ToMV تماثلا مع عزلاته من باقي البلدان.

كما تماثلت العزلات السورية من فيروس ToMV مع بعض عزلات فيروس موزاييك التبغ (TMV) Tobacco masaic virus الآسيوية أيضا، بنسب تراوحت ما بين 81 و 99 %.

تم إيداع تسلسل النكليوتيدات لمورثة أنزيم تضاعف الــRNA للعزلات السورية المختبرة من فيروس ToMV في المركز الوطني لمعلومات التقانات الحيوية (NCBI) و أعطيت أرقام الإدخال من JN561621 إلى JN561626.