A Systolic Array-Based FPGA Parallel Architecture for the BLAST Algorithm
المؤلفون المشاركون
Guo, Xinyu
Devabhaktuni, Vijay
Wang, Hong
المصدر
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-09-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A design of systolic array-based Field Programmable Gate Array (FPGA) parallel architecture for Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) Algorithm is proposed.
BLAST is a heuristic biological sequence alignment algorithm which has been used by bioinformatics experts.
In contrast to other designs that detect at most one hit in one-clock-cycle, our design applies a Multiple Hits Detection Module which is a pipelining systolic array to search multiple hits in a single-clock-cycle.
Further, we designed a Hits Combination Block which combines overlapping hits from systolic array into one hit.
These implementations completed the first and second step of BLAST architecture and achieved significant speedup comparing with previously published architectures.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Guo, Xinyu& Wang, Hong& Devabhaktuni, Vijay. 2012. A Systolic Array-Based FPGA Parallel Architecture for the BLAST Algorithm. ISRN Bioinformatics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-453615
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Guo, Xinyu…[et al.]. A Systolic Array-Based FPGA Parallel Architecture for the BLAST Algorithm. ISRN Bioinformatics No. 2012 (2012), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-453615
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Guo, Xinyu& Wang, Hong& Devabhaktuni, Vijay. A Systolic Array-Based FPGA Parallel Architecture for the BLAST Algorithm. ISRN Bioinformatics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-453615
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-453615
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر