Predicting Mycobacterium tuberculosis Complex Clades Using Knowledge-Based Bayesian Networks
المؤلفون المشاركون
Vandenberg, Scott
Aminian, Minoo
Shabbeer, Amina
Rastogi, Nalin
Hadley, Kane
Couvin, David
Bennett, Kristin P.
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-04-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
We develop a novel approach for incorporating expert rules into Bayesian networks for classification of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) clades.
The proposed knowledge-based Bayesian network (KBBN) treats sets of expert rules as prior distributions on the classes.
Unlike prior knowledge-based support vector machine approaches which require rules expressed as polyhedral sets, KBBN directly incorporates the rules without any modification.
KBBN uses data to refine rule-based classifiers when the rule set is incomplete or ambiguous.
We develop a predictive KBBN model for 69 MTBC clades found in the SITVIT international collection.
We validate the approach using two testbeds that model knowledge of the MTBC obtained from two different experts and large DNA fingerprint databases to predict MTBC genetic clades and sublineages.
These models represent strains of MTBC using high-throughput biomarkers called spacer oligonucleotide types (spoligotypes), since these are routinely gathered from MTBC isolates of tuberculosis (TB) patients.
Results show that incorporating rules into problems can drastically increase classification accuracy if data alone are insufficient.
The SITVIT KBBN is publicly available for use on the World Wide Web.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Aminian, Minoo& Couvin, David& Shabbeer, Amina& Hadley, Kane& Vandenberg, Scott& Rastogi, Nalin…[et al.]. 2014. Predicting Mycobacterium tuberculosis Complex Clades Using Knowledge-Based Bayesian Networks. BioMed Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-469027
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Aminian, Minoo…[et al.]. Predicting Mycobacterium tuberculosis Complex Clades Using Knowledge-Based Bayesian Networks. BioMed Research International No. 2014 (2014), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-469027
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Aminian, Minoo& Couvin, David& Shabbeer, Amina& Hadley, Kane& Vandenberg, Scott& Rastogi, Nalin…[et al.]. Predicting Mycobacterium tuberculosis Complex Clades Using Knowledge-Based Bayesian Networks. BioMed Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-469027
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-469027
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر