Cloning, Sequencing, and In Silico Analysis of β-Propeller Phytase Bacillus licheniformis Strain PB-13
المؤلفون المشاركون
Verma, A. K.
Kumar, Vinod
Agrawal, Sanjeev
Sangwan, Punesh
Singh, Gopal
المصدر
Biotechnology Research International
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-04-24
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
β-Propeller phytases (BPPhy) are widely distributed in nature and play a major role in phytate-phosphorus cycling.
In the present study, a BPPhy gene from Bacillus licheniformis strain was expressed in E.
coli with a phytase activity of 1.15 U/mL and specific activity of 0.92 U/mg proteins.
The expressed enzyme represented a full length ORF “PhyPB13” of 381 amino acid residues and differs by 3 residues from the closest similar existing BPPhy sequences.
The PhyPB13 sequence was characterized in silico using various bioinformatic tools to better understand structural, functional, and evolutionary aspects of BPPhy class by multiple sequence alignment and homology search, phylogenetic tree construction, variation in biochemical features, and distribution of motifs and superfamilies.
In all sequences, conserved sites were observed toward their N-terminus and C-terminus.
Cysteine was not present in the sequence.
Overall, three major clusters were observed in phylogenetic tree with variation in biophysical characteristics.
A total of 10 motifs were reported with motif “1” observed in all 44 protein sequences and might be used for diversity and expression analysis of BPPhy enzymes.
This study revealed important sequence features of BPPhy and pave a way for determining catalytic mechanism and selection of phytase with desirable characteristics.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kumar, Vinod& Singh, Gopal& Sangwan, Punesh& Verma, A. K.& Agrawal, Sanjeev. 2014. Cloning, Sequencing, and In Silico Analysis of β-Propeller Phytase Bacillus licheniformis Strain PB-13. Biotechnology Research International،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-502481
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kumar, Vinod…[et al.]. Cloning, Sequencing, and In Silico Analysis of β-Propeller Phytase Bacillus licheniformis Strain PB-13. Biotechnology Research International No. 2014 (2014), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-502481
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kumar, Vinod& Singh, Gopal& Sangwan, Punesh& Verma, A. K.& Agrawal, Sanjeev. Cloning, Sequencing, and In Silico Analysis of β-Propeller Phytase Bacillus licheniformis Strain PB-13. Biotechnology Research International. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-502481
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-502481
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر