Assessment of genetic variations in wild arum species from Jordan using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers
Other Title(s)
تقييم التباين الوراثي لأنواع اللوف في الأردن
Joint Authors
Miqdadi, Husayn
Makhadimah, Ibrahim M.
al-Lawzi, Siham
Duwayri, Muhammad
al-Khawlidah, Rida Abd Allah Urayq Shibli
Source
Jordan Journal of Agricultural Sciences
Issue
Vol. 6, Issue 2 (30 Jun. 2010), pp.224-239, 16 p.
Publisher
University of Jordan Deanship of Academic Research (DAR)
Publication Date
2010-06-30
Country of Publication
Jordan
No. of Pages
16
Main Subjects
Topics
Abstract AR
اللوف (Arum spp.) نبات عشبي معمر، ينتمي للعائلة اللوفية.
و لغاية الآن، لا تتوفر دراسات منشورة في الأردن تتعلق بتقييم التباين الوراثي لنبات اللوف البري.
تم إجراء هذا البحث لتقييم مستويات التباين الوراثي لهذا النبات اعتمادا على المعلمات الوراثية.
و قد تم تحديد إحدى و عشرين موقعاً تمت فيها دراسة هذا النبات، و توزعت المواقع في (8) محافظات في الأردن.
بلغ عدد العينات التي تم جمعها من المواقع كلها 210) نباتات)، و لكن استخدم 40 نباتا فقط في الدراسة الجزيئية، و بلغ عدد الأنواع التي تتبع لها هذه العينات ثلاثة أنواع (اللوف الفلسطيني، و اللوف المبرقش، و اللوف المائي).
تم استخدام تقنية مكاثرة قطع DNA متباينة الطول (AFLP) لدراسة التباين الوراثي في مجتمعات نباتات اللوف المختلفة.
و قد تم استخدام ستة أزواج من البادئات الانتقائية لتوليد ما مجموعه 2882 من المعلمات الوراثية ذات الحزم الواضحة و المختلفة في الحجم، منها 98.6 % كانت متباينة.
تم استخدام معامل ناي (NEI) لإنشاء جداول قيم البعد الوراثي و لإنشاء مخططات القرابة.
أمّا عن درجات التباين لأنواع اللوف المختلفة، فقد بلغ معدل التباين لهذه الأنواع 25 %.
و قد تبين أن نباتات اللوف التابعة للنوع نفسه قد تجمعت في مجموعة واحدة بغض النظر عن المواقع التي تم الجمع منها.
إن هذا المدى الواسع لمعامل التباين في نباتات اللوف يدل على عظم التباين الوراثي بين هذه الأنواع.
تعتبر تقنية مكاثرة قطع DNA متباينة الأطوال (AFLP) طريقة فعالة و مفيدة في دراسات التباين الوراثي لنبات اللوف.
و تعتبر هذه الدراسة الأولى من نوعها في الأردن التي تستخدم البصمة الوراثية (DNA) لتوصيف التنوع الوراثي لنبات اللوف و تغطيته في الأردن.
النتائج التي تم تحقيقها من هذه الدراسة سوف تكون لها أهمية كبيرة، و هي تشكل أساساً لدراساتٍ أخرى تهدف إلى وضع استراتيجيات لحفظ المادة الوراثية لهذا النبات وٕ إدامتها عن طريق تأسيس بنوك وراثية من أجل عمليات الحفظ داخل الموقع و خارج الموقع لهذا النبات.
Abstract EN
Arum is a wild herbaceous tuberous perennial plant belonging to the Araceae family.
So far, there is no report published in Jordan about the application of molecular markers to characterize wild Arum plant.
This study was initiated to assess levels of genetic variation of this plant using molecular markers.
Twenty one locations were surveyed to assess the genetic variation in this plant.
Ten plants from each location were collected and measured directly in the field.
In total, 210 plants were studied and three species were found in the 21 locations.
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique was used to study the genetic variation among Arum species.
Six combinations of selective primers were generating a total of 2882 reproducible and clearly scorable bands of different sizes ; 98.6 % of them were polymorphic.
Genetic distance was constructed based on Nei dissimilarity coefficient.
The overall genetic distance between Arum species was 25 %.
The results showed that Arum populations of the same species or having a common genome were grouped in the same cluster, regardless of the collection site.
The wide range of genetic distance was represented by the high level of DNA polymorphism occurring among Arum species.
The high level of reproducibility indicates that AFLP method is an effective approach to detect genetic variation among Arum species.
Results attained in this study will be of great importance for further work aiming at establishing a conservation strategy for preserving and maintaining the germplasm of this plant using in situ and ex situ gene banks.
American Psychological Association (APA)
Makhadimah, Ibrahim M.& al-Lawzi, Siham& Duwayri, Muhammad& al-Khawlidah, Rida Abd Allah Urayq Shibli& Miqdadi, Husayn. 2010. Assessment of genetic variations in wild arum species from Jordan using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 6, no. 2, pp.224-239.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-272859
Modern Language Association (MLA)
Makhadimah, Ibrahim M.…[et al.]. Assessment of genetic variations in wild arum species from Jordan using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 6, no. 2 (Jun. 2010), pp.224-239.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-272859
American Medical Association (AMA)
Makhadimah, Ibrahim M.& al-Lawzi, Siham& Duwayri, Muhammad& al-Khawlidah, Rida Abd Allah Urayq Shibli& Miqdadi, Husayn. Assessment of genetic variations in wild arum species from Jordan using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2010. Vol. 6, no. 2, pp.224-239.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-272859
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 236-238
Record ID
BIM-272859
