Comparative study between vibrio cholera isolated from patients and from surface water in Iraq using PULS field gel electrophoresis

Other Title(s)

دراسة مقارنة بين ضمات الكوليرا المعزولة من مرضى الكوليرا و تلك المعزولة من المياه السطحية في العراق باستخدام جهاز الترحيل الكهربائي ذا الحقل النبضي

Joint Authors

al-Ubaydi, Rana Muhammad Abd
al-Thuwayni, Aminah Nimah

Source

Iraqi Journal of Biotechnology

Issue

Vol. 9, Issue 4 (31 Dec. 2010), pp.838-848, 11 p.

Publisher

University of Baghdad Genetic Engineering and Biotechnology for Postgraduate Studies

Publication Date

2010-12-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

11

Main Subjects

Biology

Topics

Abstract AR

تضمن البحث دراسة و بائية جزيئية لبكتيريا الكوليرا بنوعيها العزلات السريرية (9 عزلات) و التي تم الحصول عليها من مختبر الصحة المركزي - بغداد خلال سنة 2006-2004، و العزلات البيئية (5 عزلات) و التي تم الحصول عليها من المياه السطحية من بغداد و بعض المحافظات و باستعمال طريقتين : الأولى عزل و ترحيل DNA البلازميدي بواسطة الترحيل الكهربائي و الثانية عزل و ترحيل DNA الكروموسومي بواسطة الترحيل الكهربائي ذا الحقل النبضي (PFGE) لغرض الكشف عن مصدر الإصابة بمرض الكوليرا.

أظهرت النتائج إن 8 من العزلات السريرية كانت ضمات الكوليرا ذات النمط المصلي O1 و نمط تحط المصلي Ogawa و Inaba و أن عزلة واحدة فقط كانت ذات نمط مصلي Non O1, بينما كانت كل العزلات البيئية ذات نمط مصلي Non O1، كما كانت جميع العزلات من O1 تعود للنمط الحيوي الطري، و أكدت نتائج فحص DNA عدم وجود DNA بلازميدي في العزلات السريرية و البيئية، بينما أعطى التحليل الكروموسومي بواسطة التحليل الكهربائي ذا الحقل النبضي توزيعا مناسبا للقطع الكروموسومية المهضومة بواسطة الإنزيم القاطع Not I لينتج 9 حزم من DNA للضمات ذات النمط تحت المصلي O1, Inaba و النمط الحيوي El-tor و بحجم جزئي يتراوح بين 425-50 كيلو قاعدة، بينما لم يتم تحليل نتائج الضمات ذات النمط تحت المصلي Ogawa و التي عزلت من المرضى لأنها ظهرت بشكل مسحة على الهلام المستخدم.

Abstract EN

The current work include the molecular epidemiological study of two types of V.

cholera, the clinical isolates (9 isolates) which have been taken from laboratory health center–Baghdad, during 2004-2006 and the environmental isolates(5 isolates), recovered from surface water in Baghdad and some governorates by using two methods, the first one the isolation and electrophoresis of plasmid DNA through Gel electrophoresis, the second, the isolation and electrophoresis of chromosomal DNA using PFGE for the detection source of Cholera infection.

Results revealed eight clinical isolates were V.

Cholera type O1 and subtype Ogawa and Inaba, only one of them was type non O1, while all the environmental isolates were non OI type, beside, all isolates from O1 belonged to El-Tor type.

The results of DNA investigation revealed the absence of DNA plasmid in clinical and environmental isolates.While the chromosomal analysis using PFGE showed normal distribution of cutting chromosomes digested by restriction enzyme not I revealing nine bands of DNA of Cholera subtype Inaba, O1 and Altor type with molecular weight ranging 50-425 kb base.

No investigation done for Cholera subtype Ogawa which had been isolated from patient, because it appears like a smear on the gel used.

American Psychological Association (APA)

al-Thuwayni, Aminah Nimah& al-Ubaydi, Rana Muhammad Abd. 2010. Comparative study between vibrio cholera isolated from patients and from surface water in Iraq using PULS field gel electrophoresis. Iraqi Journal of Biotechnology،Vol. 9, no. 4, pp.838-848.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309167

Modern Language Association (MLA)

al-Thuwayni, Aminah Nimah& al-Ubaydi, Rana Muhammad Abd. Comparative study between vibrio cholera isolated from patients and from surface water in Iraq using PULS field gel electrophoresis. Iraqi Journal of Biotechnology Vol. 9, no. 4 (2010), pp.838-848.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309167

American Medical Association (AMA)

al-Thuwayni, Aminah Nimah& al-Ubaydi, Rana Muhammad Abd. Comparative study between vibrio cholera isolated from patients and from surface water in Iraq using PULS field gel electrophoresis. Iraqi Journal of Biotechnology. 2010. Vol. 9, no. 4, pp.838-848.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309167

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 847-848

Record ID

BIM-309167