Identification Pseudomonas aeruginosa by 16s rRNA gene for differentiation from other pseudomonas species that isolated from patients and environment
Other Title(s)
تشخيص بكتريا Pseudomonas aeruginosa بجين 16s rRNA لتفريقها عن بقية أنواع جنسها المعزولة من المرضى و البيئة
Joint Authors
Marhun, Abir Ali
al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud
Aziz, Ismail Husayn
Source
Issue
Vol. 11, Issue 2(s) (30 Jun. 2014), pp.1028-1034, 7 p.
Publisher
University of Baghdad College of Science for Women
Publication Date
2014-06-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
7
Main Subjects
Topics
Abstract AR
تعد بكتريا الـ Pseudomonas aeruginosa الأكثر شيوعا و خطورة من بين الممرضات الانتهازية التي تصيب الإنسان، إذ تسبب العديد من الأمراض المعدية الخطرة التي تؤدي إلى الموت في بعض الأحيان مثال ذلك التكيس الليفي، التهاب الجروح، التهاب الحروق، التهاب المجاري البولية، و العديد من الإصابات الأخرى.
لذلك أصبح من المهم جدا إيجاد طريقة سريعة و دقيقة لتشخيص بكتريا الـ Pseudomonas aeruginosa من العينات المرضية المزروعة على الأوساط الزرعية و ذلك لأن تشخيص هذا النوع يواجه مشكلة التغاير في النمط المظهري الملحوظ في العينات المعزولة التي تحتوي على العديد من الأنواع المتقاربة جدا فيما بينها و أبسط طريقة للتفريق بين هذه الأنواع هي استخدام الـ 16SrRNA الذي يعطي تشخيصا للجنس و النوع إذ يعد الشفرة الوراثية الثابتة للنوع و بذلك.
هدفت هذه الدراسة إلى إيجاد تشخيص سريع و بسيط و دقيق بتقنية PCR يهيأ لنا تشخيص بكتريا ال Pseudomonas aeruginosa و تفريقها عن باقي أنواع جنسها و أجناس مرضية أخرى و كذلك يعتبر هذا الاختبار الأدق من بين الاختبارات التشخيصية الأخرى مثل الـ (20) APT حيث يعطي نسبة 70 % في حين يعطي التشخيص بالـ 16SrDNA أكثر من % 90.
Abstract EN
Pseudomonas aeruginosa is a common and major opportunistic human pathogen, its causes many and dangersinfectious diseases due to death in some timesex: cystic fibrosis , wounds inflammation , burns inflammation , urinary tract infection , other many infections otitis external , Endocarditis , nosocomial infection and also causes other blood infections (Bacteremia).
thereforebecomes founding fast and exact identification of P.
aeruginosafrom samples culture very important.However, identification of this species may be problematic due to the marked phenotypic variabilitydemonstrated by samples isolates and the presence of other closely related species.
To facilitate species identification, we used 16S ribosomal DNA(rRNA) sequence data toidentify genus- and species-specific 16S rRNA signature sequences,its account a stable part of the geneticcode.
Based on these sequences we designed simple, rapid, and accurate PCR assays that allow the differentiation of P.
aeruginosa from Pseudomonas species and other pathogen genus ,also this test considered as the most specific than the other diagnostic tests like API (20) which give 70% while the 16SrRNA test give more than 90 %
American Psychological Association (APA)
Marhun, Abir Ali& Aziz, Ismail Husayn& al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud. 2014. Identification Pseudomonas aeruginosa by 16s rRNA gene for differentiation from other pseudomonas species that isolated from patients and environment. Baghdad Science Journal،Vol. 11, no. 2(s), pp.1028-1034.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-643178
Modern Language Association (MLA)
Marhun, Abir Ali…[et al.]. Identification Pseudomonas aeruginosa by 16s rRNA gene for differentiation from other pseudomonas species that isolated from patients and environment. Baghdad Science Journal Vol. 11, no. 2 (2014), pp.1028-1034.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-643178
American Medical Association (AMA)
Marhun, Abir Ali& Aziz, Ismail Husayn& al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud. Identification Pseudomonas aeruginosa by 16s rRNA gene for differentiation from other pseudomonas species that isolated from patients and environment. Baghdad Science Journal. 2014. Vol. 11, no. 2(s), pp.1028-1034.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-643178
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 1032-1033
Record ID
BIM-643178