Development of in-house Taqman qPCR assay to detect equine herpesvirus-2 in al-Qadisiyah City

Other Title(s)

تطوير تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل الكمي (المحلي)‎ للكشف عن فايروس هربس الخيول النمط الثاني

Author

Abd al-Kazim, Muhammad Hamzah

Source

Iraqi Journal of Veterinary Sciences

Issue

Vol. 34, Issue 2 (31 Dec. 2020), pp.365-371, 7 p.

Publisher

University of Mosul College of Veterinary Medicine

Publication Date

2020-12-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

7

Main Topic

Veterinary Medicine

Topics

Abstract AR

ينتشر فيروس هربس الخيول النمط الثاني في الخيول عالمياً، و يصنف تحت عائلة الفيروسات كاما هربس و جنس البيركافايروس.

هناك طورين للإصابة بالفيروس و هما : الكامن و الفعال.

اذ يرتبط الشكل الفعال بالأعراض التنفسية و التناسلية.

أما في الطور الكامن للفيروس فيكون في حالة من السكون داخل خلايا المضيف و لغاية تنشيط الفايروس.

أظهرت دراستنا السابقة تواجد الفيروس بالأنسجة الوترية للخيول مما قد يشير إمكانية حمل الفيروس بخلايا الدم البيض و التي قد تعمل على نشر الإصابة الجهازية.

كما و سبق أن أجريت العديد من الدراسات التشخيصية و المعتمدة على تقنية تفاعل سلسلة البلمرة و المستهدفة تضخيم الجين المسؤول عن إنتاج البروتين السكري نوع gB، إلا أن هذا الجين متغاير بشكل كبير لذلك هناك ضرورة لتطوير تقنية جزيئية لها القابلية على قياس المستوى الكمي للفيروس الخامل.

استهدفت الدراسة الحالية تطوير تلك التقنية بالاعتماد على تضخيم جين غير متغاير نمطياً باستخدام بلازميد حاوي على ذلك الجين لغرض استخدامه كمنحنى قياس معاير.

أظهرت النتائج الحالية نسبة إصابة بالفايروس بلغت ٣٣ ٪، اذ بلغ أعلى مقياس للفيروس ٦٦٤٧ نسخة / ١٠٠ نانوغرام دنا بينما أقل نسبة بلغت ٢ نسخة / ١٠٠ نانوغرام دنا، أما قيمة المتوسط الإحصائي فقد بلغت ١٤١ نسخة / ١٠٠ نانوغرام دنا.

إن تطوير هذه التقنية الكمية لقياس نسبة فايروس هربس الخيول النمط الثاني ممكن أن تساعد في السيطرة على المرض.

Abstract EN

EHV-2 is distributed in horses globally.

It is clustered within gamma-herpesvirus subfamily and percavirus genus.

EHV-2 infection has two phases: latent and lytic.

In the later, EHV-2 mainly associated with respiratory and genital symptoms.

However, in the quiescent phase of infection, EHV-2 stay dormant in the host till viral reactivation.

Our previous study has showed that EHV-2 can be harboured by equine tendons, suggesting that leukocytes possibly carrying EHV-2 for the systemic dissemination.

So far, numerous PCR protocols have been performed targeting the gB gene.

However, this gene is heterogenic.

Therefore, there is a need to develop a quantitative diagnostic approach to detect the quiescent EHV-2 strains.

To do this, Taqman qPCR assay was developed to quantify the virus.

This was performed by targeting a highly conserved gene known as DNA polymerase (DPOL) gene using constructed plasmid as a standard curve calibrator.

The obtained results showed an infection frequency of 33% in which the EHV-2 load reached 6647 copies/100 ng DNA whereas the minimum load revealed as 2 copies/100 ng DNA.

The median quantification was found as 141 copies/ 100 ng DNA.

Establishment of a credited qPCR assay to quantify EHV-2 could be helpful in the control of the disease.

American Psychological Association (APA)

Abd al-Kazim, Muhammad Hamzah. 2020. Development of in-house Taqman qPCR assay to detect equine herpesvirus-2 in al-Qadisiyah City. Iraqi Journal of Veterinary Sciences،Vol. 34, no. 2, pp.365-371.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-973307

Modern Language Association (MLA)

Abd al-Kazim, Muhammad Hamzah. Development of in-house Taqman qPCR assay to detect equine herpesvirus-2 in al-Qadisiyah City. Iraqi Journal of Veterinary Sciences Vol. 34, no. 2 (2020), pp.365-371.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-973307

American Medical Association (AMA)

Abd al-Kazim, Muhammad Hamzah. Development of in-house Taqman qPCR assay to detect equine herpesvirus-2 in al-Qadisiyah City. Iraqi Journal of Veterinary Sciences. 2020. Vol. 34, no. 2, pp.365-371.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-973307

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 369-371

Record ID

BIM-973307