Identification of sex-specific molecular markers in barbell and Nile carp using scot and ISSR markers

Other Title(s)

تحديد الواسمات الجزيئية الخاصة بالجنس في أسماك الليبس النيلي و البني الأصيل باستخدام واسمات SCoT و ISSR

Joint Authors

Muhammad, G. I. A.
Mahjub, Aya Ahmad
Abd al-Munsif, Muhammad al-Sayyid
Yusuf,.

Source

Assuit Journal of Agricultural Sciences

Issue

Vol. 52, Issue 1 (31 Mar. 2021), pp.60-73, 14 p.

Publisher

Assiut University Faculty of Agriculture

Publication Date

2021-03-31

Country of Publication

Egypt

No. of Pages

14

Main Subjects

Agriculture

Topics

Abstract AR

كان الهدف من الدراسة الحالية دراسة الفروق الجنسية بين الذكور و الإناث في نوعين من الأسماك التابعين للعائلة Cyprinidae في مصر المعروفين باسم البني و الليبس وذلك باستخدام نوعين من الواسمات الجزيئية الـ SCoT و الـ ISSR.

تم تحليل المادة الوراثية المجمعة من عدة أفراد لكل جنس من كلا النوعين بواسطة ثماني بادئات من كل واسم جزيئي.

إتضح أن الواسم SCoT كان أكثر فعالية من الواسم ISSR من خلال إظهار عدد أكبر من الحزم المحتمل أنها خاصة بالجنس في كلا النوعين تحت الدراسة.

حيث أنتجت البادئات الخاصة بالـ SCoT عدد سبعة حزم و أربعة حزم خاصة بالذكور و أيضا عدد حزمتين و خمسة حزم خاصة بالإناث في السمك البني و الليبس على الترتيب.

بينما أظهر الواسم ISSR عدد أربعة حزم و حزمتين خاصة بالذكور بالإضافة إلى عدد حزمتين و ثلاث حزم خاصة بالإناث في نوعي البني و الليبس على الترتيب.

و جدير بالذكر تمكن البادئ (SCoT-01) من إنتاج حزمة فريدة خاصة فقط بالإناث من كلا النوعين (بحجم 690 زوج قاعدة نيتروجينية).

و من المرجح أن تكون هذه الحزمة متخصصة بجنس الإناث و بالتالي فيجب عزلها و تحديد التتابع الخاص بها.

تعتبر النتائج المتحصل عليها في هذه الدراسة بغاية من الأهمية حيث يمكن اعتبارها حجر أساس لدراسات تمييز الجنس في نوعي السمك محل الدراسة و الأنواع السمكية الأخرى.

و لكن من الموصي به زيادة عدد الأفراد الواجب تحليلهم في الدراسات المقبلة.

Abstract EN

The present study aimed to investigate molecular sex differences between males and females of two members of family Cyprinidae in Egypt namely Benni and Lebeis using two different molecular markers i.

e.

, start codon targeted polymorphism (SCoT) and inter simple sequence repeats (ISSR).

The bulked DNA sample for each gender of the tested species was screened with eight primers from each marker.

However, SCoT marker was more efficient than ISSR marker by showing higher number of possible sex-specific bands in the two tested species.

SCoT primers were able to generate 7 and 4 male-specific bands, along with two and 5 female-specific bands for B.

bynni and L.

niloticus, respectively.

Whereas, ISSR primers generated 4 and two male-specific bands, vis-à-vis two and three female-specific bands for B.

bynni and L.

niloticus, respectively.

Interestingly, SCoT-01 primer generated unique common female specific band (690bp) which appeared only in the females of Benni and Lebeis.

This band is more possible to be female sex-specific.

The results obtained in this study could serve as a keystone for molecular sex differentiation studies in the two tested species and other fish species.

However, increasing the number of analyzed individuals is highly recommended.

American Psychological Association (APA)

Mahjub, Aya Ahmad& Abd al-Munsif, Muhammad al-Sayyid& Yusuf,.& Muhammad, G. I. A.. 2021. Identification of sex-specific molecular markers in barbell and Nile carp using scot and ISSR markers. Assuit Journal of Agricultural Sciences،Vol. 52, no. 1, pp.60-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1255413

Modern Language Association (MLA)

Mahjub, Aya Ahmad…[et al.]. Identification of sex-specific molecular markers in barbell and Nile carp using scot and ISSR markers. Assuit Journal of Agricultural Sciences Vol. 52, no. 1 (2021), pp.60-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1255413

American Medical Association (AMA)

Mahjub, Aya Ahmad& Abd al-Munsif, Muhammad al-Sayyid& Yusuf,.& Muhammad, G. I. A.. Identification of sex-specific molecular markers in barbell and Nile carp using scot and ISSR markers. Assuit Journal of Agricultural Sciences. 2021. Vol. 52, no. 1, pp.60-73.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1255413

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

-

Record ID

BIM-1255413