Polymorphism of LEP and TNF-α genes in the dairy cattle populations of Ukrainian selection
Other Title(s)
تعدد الطرز الشكلية لجينات LEP و TNF-α في مجتمعات ماشية الحليب الأوكرانية
Joint Authors
Kulibaba, Roman
Liashenko, Yuriy
Yurko, Polina
Sakhatskyi, Mykola
Osadcha, Yulia
al-Shamaylah, Hamzah
Source
Basrah Journal of Agrricultural Science
Issue
Vol. 34, Issue 1 (30 Jun. 2021), pp.180-191, 12 p.
Publisher
University of Basrah Agriculture College
Publication Date
2021-06-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
12
Main Subjects
Topics
Abstract AR
نفذت الدراسة الحالية لتحديد التركيب الجيني في ماشية الحليب الأوكرانية من الهجائن الأبيض و الأسود و الأحمر و-الأبيض لماشية الحليب لجين leptin gene (LEP) و and tumor necrosis factor-alpha gene (TNF-α) .
نفذت الدراسة اعتمادا على تفاعل التسلسل البلمري PCR و التحليل بالهضم للجين LEP، فضلا عن استخدام التقانة ذاتها مع الجين TNF-α مع تحليل SSCP .
طبقا لنتائج الدراسة الحالية وجد إن الجين LEP متعدد الطرز الشكلية في كلا مجتمعي هجائن الماشية قيد البحث من خلال HphI في الامتداد الثالث للأكسون المتعلق بالجين ) A59V mutation (.
ما يخص مجتمع الهجين من النوع الأبيض و الأسود لماشية الحليب الأوكرانية كان تكرار الأليل من نوع C (HphI-) بقيمة 0.77 ، و الأليل T (HphI+) بقيمة - 0.23 .
كما وجد إن قيمة معامل Wrights fixation كانت 0.23 ، و التي أشارت إلى زيادة في عدد الأفراد المتناظرة.
و وجد انحرافا في حالة Hardy-Weinberg equilibrium .
أما عن مجتمع هجين ماشية الحليب الأحمر و الأبيض وجد أن تكرار الأليل C بقيمة بلغت 0.72 ، والأليل T كان - 0.28 ، و قيمة معامل Wrights fixation كانت بمعدل - 0.18 .
وفيما يتعلق بالتحليل SSCP ، بينت النتائج مع الجين TNF-α وجود ستة اليلات بأحجام تراوحت بين 450 - 1200 زوج قاعدة، وهي: Aو B و C و D و E و F للهجين الأحمر و الأبيض.
و كان تكرار الأليل A سائدا في كلا هجيني ماشية الحليب الأوكرانية وبقيمة بلغت 0.58 و 0.54 ، على التوالي.
أما فيما يخص الأليلات C و D و E كانت بتكرارات واطئة بمدى بلغ 0.04 - 0.16 و وجدت فقط في هجين الماشية الأحمر و الأبيض.
Abstract EN
Study was conducted by investigating the genetic structure of cattle populations of Ukrainian Black-and-White and Ukrainian Red-and-White dairy breeds by polymorphism of leptin gene (LEP) and tumor necrosis factor-alpha gene (TNF-α).
The studies were carried out using the method of polymerase chain reaction (PCR) and restriction analysis for LEP and using classic PCR with subsequent SSCP analysis in case of TNF-α.
According to the results of the study, it was shown that the LEP gene was polymorphic in both experimental populations by HphI-polymorphism in the third exon of the gene (A59V mutation).
In the population of the Ukrainian Black-and-White dairy cattle breed, the frequency of allele C (HphI-) was 0.77; allele T (HphI+) – 0.23.
Wright's fixation index was 0.23; which indicates a significant excess in the number of homozygous individuals.
This population had a deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium state.
In the population of the Ukrainian Red-and-White dairy breed, the frequency of allele C was 0.72; allele T – 0.28; Wright's fixation index was -0.18.
According to the SSCP-polymorphism of the TNF-α gene, 6 alleles with a size of 450-1200 bp were detected (alleles A, B, and F for Ukrainian Black-and-White dairy breed; A, B, C, D, Е, F – for Ukrainian Red-and-White dairy breed).
The frequency of allele A prevailed in the populations of both breeds (0.58 and 0.54, respectively).
Alleles C, D, and E had a low frequency of occurrence (0.04-0.16) and they were found only in the population of Red-and-White dairy breed.
American Psychological Association (APA)
Kulibaba, Roman& Liashenko, Yuriy& Yurko, Polina& Sakhatskyi, Mykola& Osadcha, Yulia& al-Shamaylah, Hamzah. 2021. Polymorphism of LEP and TNF-α genes in the dairy cattle populations of Ukrainian selection. Basrah Journal of Agrricultural Science،Vol. 34, no. 1, pp.180-191.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258842
Modern Language Association (MLA)
Kulibaba, Roman…[et al.]. Polymorphism of LEP and TNF-α genes in the dairy cattle populations of Ukrainian selection. Basrah Journal of Agrricultural Science Vol. 34, no. 1 (2021), pp.180-191.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258842
American Medical Association (AMA)
Kulibaba, Roman& Liashenko, Yuriy& Yurko, Polina& Sakhatskyi, Mykola& Osadcha, Yulia& al-Shamaylah, Hamzah. Polymorphism of LEP and TNF-α genes in the dairy cattle populations of Ukrainian selection. Basrah Journal of Agrricultural Science. 2021. Vol. 34, no. 1, pp.180-191.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1258842
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 188-190
Record ID
BIM-1258842