الكشف عن وجود قابلية تحمل الملوحة في بعض تراكيب البنجر السكري باستخدام تقانة PCR

Abstract AR

استخلص DNA من بادرت ثمانية أصناف من البنجر السكري (Beta vulgaris), ستة منها تزرع في ولاية مشيغن (13698 EL-EL-AO 21483 AO و 22799 EL-AO و 22438 EL-AO و 15037 EL-AO و 15028 EL-AO) و صنف مستورد (Swiss) و تركيب بري (Wild) باستخدام خمسة بادئات لخمسة مواقع جينية تتصف بأنها جينات متحملة للملوحة تم إنتاجها من شركة Integrated DNA Technology IDT) Company) في مختبرات كلية علوم النبات و التربة / جامعة مشيغن الأميركية في العام 2011.

كان الهدف من تطبيق التجربة تشخيص وجود بعض جينات تحمل الملوحة و تقدير درجة البعد للوراثي للتراكيب الوراثية باستخدام تقانة PCR.

تم حساب درجة التباعد الوراثي ثم أنشىء الشكل العنقودي (cluster) بالاعتماد على طريقة agglomerative لتبسيط البيانات عن طريق تجميع التراكيب الوراثية في مجاميع للصفات المدروسة حسب تشابه نمط الاستجابة أدى استخدام البادئات إلى تكوين 27 حزمة كانت جميعها من نوع polymorphic.

اختلف عدد الحزم المنتجة من 4-7 حسب البادئ و أنتج البادئان BVU07582-U BVU07582-m أعلى عدد من الحزم.

توصلت التراكيب الوراثية المدروسة إلى ثلاث مجاميع عند تطبيق التحليل العنقودي حاسب تشابه و اختلاف مواقعها الأليلية، إذ ضمت المجموعة الأولى (A) ثلاثة تراكيب هي 22799 EL-AO و-EL AO22438 و 15028 EL-AO و المجموعة الثانية (B) أربعة تراكيب وراثية هي 13698 EL-AO وSWiss و 15037 EL-AO و EL-AO 21483 و الثالثة (C) تركيب وراثي واحد هو Wild.

كان التركيب Wild الأبعد وراثيا عن جميع التراكيب المدروسة.

كانت نسبة البعد الوراثي منخفضة و متساوية بين تركيب المجموعة A و أعطت حزما لجميع البادئات و هذا يعكس استجابة هذه التركيب بشكل متماثل لجميع البادئات المستخدمة في حين لم تنمن أي حزمة للتركيب Wild باستثناء حزمة واحدة نتجت من البادئ F100-p49296-L.

يمكن استخدام التراكيب 22799 EL- EL-AO 22438 AO و15028 EL-AO في برامج التربية لنقل صفة الملوحة إلى تراكيب أخرى لامتلاكها جميع تتابعات البادئات المستخدمة لتشخيص جينات الملوحة.