Effect of single mismatches at 3–end of primers on polymerase chain reaction

Other Title(s)

تأثير عدم التوافق الأحادي عند نقطة الإنتهاء الثلاثي للمواد التمهيدية في سلسلة تفاعل البوليمارز (حافز البلمرة)‎

Joint Authors

Simsek, Mehmet
Adnan, H.

Source

SQU Journal for Scientific Research : Medical Sciences

Issue

Vol. 2, Issue 1 (31 Jan. 2000), pp.11-14, 4 p.

Publisher

Sultan Qaboos University College of Medicine and Health Sciences

Publication Date

2000-01-31

Country of Publication

Oman

No. of Pages

4

Main Subjects

Medicine

Abstract AR

الهدف : معرفة مدى تأثير ثلاثة أنواع من عدم التوافق بين قواعد الحمض النووي (بيتاجين الهيموجلوبين) و قواعد الانتهاء الثلاثي للمحفز.

الطريقة و النتائج : ظهر إن الارتباط الذي حدث بين زوجي القواعد الثلاث (ج / ج، ت / ج، ا / ج) ساعد في عملية التكاثر السريع للمنطقة المنشودة في جين بيتا الهيموجلوبين (الهدف)، و هي منطقة تحتوي على 268 قاعدة حمض نووي مزدوج، و ذلك باستخدام سلسلة من درجات الحرارة تراوحت بين 45 و 65 درجة مئوية، و هي ما تعرف بدرجة حرارة التلاحم المتماثل.

تلاحم قاعدتي المحفز و الهدف (ت / ج) كان قويا مثل التلاحم الطبيعي الذي يحدث بين قاعدتي (س / ج) حدث هذا التلاحم في كل درجات الحرارة المذكورة سلفا.

لم ينتج من التحام القواعد الأخرى (ج / ج أو أ / ج) أي تفاعل يذكر سوى التفاعل الضعيف للقاعدة ج / ج عند درجتي حرارة 45 و 50 درجة مئوية.

الخلاصة : إن المحفزين اللذين أمكنهما التفاعل هما زوجي القواعد (أ / ج و ج / ج) و قد تم التفاعل مع المنطقة المنشودة من جين بيتا الهيموجلوبين.

Abstract EN

Objective and Method –to investigate the effect of three different mismatches (G / T, A or G) at the 3•-end of a primer to amplify a 268 bp (base pair) region of the human •–globin gene using different annealing temperatures (45 to 65•C). Results–the primer with the T mismatch was as efficient as the normal primer (G / C match) in the amplification of a 268 bp product at all temperatures tested.

However, the primers having G / A or G / G mismatches at the 3'-end did not produce any specific polymerase chain reaction (PCR) fragment at all the annealing temperatures used, except a barely detectable 268 bp product for the G/G mismatch at 45 and 50•C. Conclusion–we conclude that our PCR system was refractory to amplification when one of the primers contained a G / A or G/G mismatch at the 3•–end with template DNA.

American Psychological Association (APA)

Simsek, Mehmet& Adnan, H.. 2000. Effect of single mismatches at 3–end of primers on polymerase chain reaction. SQU Journal for Scientific Research : Medical Sciences،Vol. 2, no. 1, pp.11-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-57601

Modern Language Association (MLA)

Simsek, Mehmet& Adnan, H.. Effect of single mismatches at 3–end of primers on polymerase chain reaction. SQU Journal for Scientific Research : Medical Sciences Vol. 2, no. 1 (Jan. 2000), pp.11-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-57601

American Medical Association (AMA)

Simsek, Mehmet& Adnan, H.. Effect of single mismatches at 3–end of primers on polymerase chain reaction. SQU Journal for Scientific Research : Medical Sciences. 2000. Vol. 2, no. 1, pp.11-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-57601

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 14

Record ID

BIM-57601