استخدام قواعد البيانات لتحديد مواضع القطع و رسم خارطة التقييد للدنا المكلمة لجين الافيدين

Abstract AR

استخدمت قواعد بيانات أنزيمات التقييد (REBASE) و البروتينات ذات العلاقة في تصميم برنامج تنفيذي بلغة Quick basic لتحديد مواضع القطع و رسم خارطة التقييد لتتابع الدنا المكملة للجين المعزول من قناة بيض الدجاج و المشفر لبروتين الأفيدين المتخصص للارتباط بالبايوتين.

و قد تم التمكن باستخدام هذا البرنامج الذي يعد ذو فائدة كبيرة في التنبؤ بأنماط التقطيع لجزيئات الدنا الارتباطية من تحديد مواضع القطع لثلاثة عشر أنزيم من بين 45 نوع من انزيمات التقييد المختلفة التي تمتلك تسلسلات تعرفية ضمن تتابع الدنا المكملة لجين الإفيدين و هي انزيمات DdeI، AluI، HinfI، (PalI) HaeIII، HhaI، (MspI) HpaII، EcoRI، HindIII، MboI، (Sau3A) و PstI.

كما تم التمكن من رسم خارطة التقييد التي تبين مواضع القطع الخاصة بهذه الأنزيمات ضمن تتابع الجين فضلا عن تحديد منطقة الدنا المشفرة لبروتين الأفيدين البالغ حجمها 460 زوج قاعدي ضمن التتابع الكلي للدنا المكملة للجين الذي يبلغ حجمه 596 زوج قاعدي.