Assessment of genetic diversity of silene (Caryophyllaceae)‎ species using ISSR molecular marker

Other Title(s)

تقييم التنوع الجيني لصنف نبات السيلينة من العائلة (القرنفلية باستخدام الواسمات الجزيئية ISSR )‎

Joint Authors

Rahmani, Fatimah
Bargish, Tahereh Aghaee

Source

Jordan Journal of Agricultural Sciences

Issue

Vol. 11, Issue 4 (31 Dec. 2015), pp.1037-1047, 11 p.

Publisher

University of Jordan Deanship of Academic Research (DAR)

Publication Date

2015-12-31

Country of Publication

Jordan

No. of Pages

11

Main Subjects

Biology
Botany

Topics

Abstract AR

في العمل الحالي، قمنا بتوظيف الواسم الجزيئي للسلسلة البسيطة المتداخلة المتكررة (ISSR)، و تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) لتقييم التنوع الجيني لثلاثة عشر نوعا من نبات سيلينة في إيران.

تضخمت ثلاثة عشر من بادئات ISSR للحمض النووي ما مجموعة 207 من شظايا الحمض النووي، منها 204 (98.85 %) من متعدد الأشكال.

و كانت القيمة التي تم الحصول عليها 0.88 (PIC).

راوح معامل التشابه Jaccard من 0.15-38.0 تبعا ل ISSR.

كشفت بيانات التحليل العنقودي ثلاث مجموعات رئيسية و كشف ISSR.، عن مستوى عال لتعدد الأشكال و تمثل الاختلاف الجيني العالي بين الأنواع المتداخلة على مستوى جنس نبات سيلينة.

Abstract EN

In the present work, we employed Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR), a polymerase chain reaction (PCR)- based system to evaluate the genetic diversity of thirteen species of Silene in Iran.

Thirteen ISSR primers amplified a total of 207 DNA fragments, of which 204 (98.85%) were polymorphic.

The obtained mean polymorphism information content (PIC) value was 0.88.

Jaccard’s similarity coefficient ranged from 0.15 to 0.38 according to ISSR.

Cluster analysis data revealed three main clusters.

ISSR detected high polymorphism level and represented high genetic variation at interspecies level in Silene genus.

American Psychological Association (APA)

Bargish, Tahereh Aghaee& Rahmani, Fatimah. 2015. Assessment of genetic diversity of silene (Caryophyllaceae) species using ISSR molecular marker. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 11, no. 4, pp.1037-1047.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-647584

Modern Language Association (MLA)

Bargish, Tahereh Aghaee& Rahmani, Fatimah. Assessment of genetic diversity of silene (Caryophyllaceae) species using ISSR molecular marker. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 11, no. 4 (2015), pp.1037-1047.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-647584

American Medical Association (AMA)

Bargish, Tahereh Aghaee& Rahmani, Fatimah. Assessment of genetic diversity of silene (Caryophyllaceae) species using ISSR molecular marker. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2015. Vol. 11, no. 4, pp.1037-1047.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-647584

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 1044-1046

Record ID

BIM-647584