Single nucleotide polymorphisms in the promoter of CYP19 gene in cattle bred in Iraq

Other Title(s)

تعدد أشكال النيوكليوتيدات الفردية (SNPs)‎ في منظم جين CYP19 في الأبقار المرباة في العر اق

Parallel Title

تعدد أشكال النيوكليوتيدات الفردية (SNPs)‎ في منظم جين CYP19 في الأبقار المرباة في العر اق

Joint Authors

al-Rushdi, Khalaf Abd al-Razzaq Hasan
Faraj, Salah Hasan
Ayid, Asad Yahya

Source

Basrah Journal of Agrricultural Science

Issue

Vol. 33, Issue 1 (30 Jun. 2020), pp.89-97, 9 p.

Publisher

University of Basrah Agriculture College

Publication Date

2020-01-31

Country of Publication

Iraq

No. of Pages

9

Main Topic

Biology
Diseases

Topics

Abstract AR

أجريت الدراسة الحالية لوصف التنوع الجيني لجين اروماتيز السيتوكروم P450 (CYP19) في 34 بقرة ) 15محلية و 14 هولشتاين و 5 صلبان( في العراق.

أهداف هذه الدراسة هي الكشف عن SNPs )الطفرات( في المنظم p1.

1 لجي نCYP19 في الأبقار المرباة في العراق باستخدام تقنيات التسلسل.

اكتشفت خمسة تشكلات متعددة للتشكلات أحادية النوكليوتي د(SNP) في جي ن CYP19، وهي G933T و G994C و A1044G و A1062T و C1468A.

أوضحت النتائج وجود 3 و4 و 2 مناطق متعددة الأشكال مما أدى إلى بناء 4 و 5 و 3 أنماط احادية مختلفة لابقارالهولشتاين والمحلية والمضربة على التوالي.

كان تنوع النمط الاحادي يساوي 0.

791 و 0.

752 و 0.

700 للسلالات المدروسة على التوالي.

بينما كان تنوع النوكليوتيدات0.

0017 و 0.

0022 و 0.

0013 على التوالي.

إلى جانب ذلك، اجري تحليل جيني للسلالات باستخدام هذه التسلسلات لحسابالعلاقة التطورية بين الأنواع الحيوانية.

تم تسجيل التسلسلات والطفرات التي تم الكشف عنها في قاعدة بيانات GenBank تحتأرقام الانضمام LC490756 و LC490757 و LC491437 و LC491438 و LC491439 و LC491588 وLC491589.

Abstract EN

The present study was undertaken to characterize the genetic diversity of the aromatase cytochrome P450 (CYP19) gene in 34 cows (15 local, 14 Holstein, and 5 Crosses) in Iraq.

The objectives of the present study are to detect SNPs (mutations) in promoter p1.

1 of the CYP19 gene in cattle bred in Iraq using sequencing techniques.

We identified five single-nucleotide polymorphisms (SNP) loci of the CYP19 gene that were detected, namely G933T, G994C, A1044G, A1062T, and C1468A.

The results showed the presence of 3, 4, and 2 polymorphic sites leading to the construction of 4, 5, and 3 different haplotypes for Holstein, local, and crosses respectively.

Haplotype diversity were 0.

791, 0.

752, and 0.

700 respectively.

While nucleotide diversity was 0.

0017, 0.

0022, and 0.

0013 respectively.

Besides, we carried out a phylogenetic analysis of these sequences to address the evolutionary relationship between the animal species.

These fragments were assigned in the GenBank database under the accession numbers: LC490756, LC490757, LC491437, LC491438, LC491439, LC491588, and LC491589.

American Psychological Association (APA)

Faraj, Salah Hasan& Ayid, Asad Yahya& al-Rushdi, Khalaf Abd al-Razzaq Hasan. 2020. Single nucleotide polymorphisms in the promoter of CYP19 gene in cattle bred in Iraq. Basrah Journal of Agrricultural Science،Vol. 33, no. 1, pp.89-97.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971518

Modern Language Association (MLA)

Ayid, Asad Yahya…[et al.]. Single nucleotide polymorphisms in the promoter of CYP19 gene in cattle bred in Iraq. Basrah Journal of Agrricultural Science Vol. 33, no. 1 (2020), pp.89-97.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971518

American Medical Association (AMA)

Faraj, Salah Hasan& Ayid, Asad Yahya& al-Rushdi, Khalaf Abd al-Razzaq Hasan. Single nucleotide polymorphisms in the promoter of CYP19 gene in cattle bred in Iraq. Basrah Journal of Agrricultural Science. 2020. Vol. 33, no. 1, pp.89-97.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971518

Data Type

Journal Articles

Language

English

Notes

Includes bibliographical references : p. 94-97

Record ID

BIM-971518