Determination of Iraqi date palms based on DNA markers
Other Title(s)
تحديد جنس نخيل التمر العراقي بالاعتماد على مؤشرات الدنا DNA
Parallel Title
تحديد جنس نخيل التمر العراقي بالاعتماد على مؤشرات الدنا DNA
Joint Authors
Ulwan, Ata Allah Ibrahim
Hatim, Layth Abd al-Karim
Ibrahim, Hamzah Abd
Yusuf, Shadha Ayid
Source
Basrah Journal for Date Palm Research
Issue
Vol. 19, Issue 1 (30 Jun. 2020), pp.18-30, 13 p.
Publisher
University of Basrah Date Palm Research Center
Publication Date
2020-06-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
13
Main Subjects
Topics
Abstract AR
يعد نخيل التمر (Phoenix dactylifera L) من النباتات أحادية الجنس ثنائية المسكن وحيدة الفلقة، لذا يصعب تمييز جنس نخيل التمر في المراحل الأولية من النمو و حتى بلوغ النضج، في وقت الإزهار الأول، و الذي يستغرق حوالي 5 -10 سنوات كي تثمر شتلات إناث النخيل، و حينئذ يمكن تمييزها عن ذكور النخيل.
يتم إكثار نخيل التمر إما بالبذور أو الفسائل.
إن التكاثر بالبذور غير مناسب للإنتاج التجاري لكون نصف الذرية هم من الذكور ونصفها الاخر من الإناث، لذا فإن تحديد الجنس المبكر في مرحلة الشتلات (تفريق الشتلات الصغيرة إلى ذكور و إناث) هو هدف مرغوب فيه اقتصاديا، مما يعزز برامج التربية للتحسينات الوراثية لنخيل التمر.
كانت هناك محاولات عديدة لاستخدام المؤشرات البايوكيميائية و الجزيئية في مرحلة مبكرة للتمييز بين الذكور و الإناث في نخيل التمر.
تم في هذه الدراسة اختبار مؤشرات جزيئية خاصة بالجنس تعتمد على تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (Polymerase Chain Reaction ( PCR و التي قد تساعد في التحديد المبكر للجنس في مرحلة الشتلات.
تم إخضاع أربعة أصناف من الذكور (غنامي أحمر، غنامي أخضر، خكري و خكري- سميسمي) و 4 أصناف مؤنثة (بريم، خضراوي مندلي، مكتوم و تبرزل) باعتماد 7 بواديء من نوع التضاعف العشوائي المتعدد الأشكال لسلسلة الدنا Random Amplifi polymorphic (RAPD)) و 8 بواديء من نوع التسلسلات البسيطة المتكررة ( SSR) لتحديد المؤشرات المرتبطة بالجنس.
أظهرت خمس بواديء من نوع SSR حزم خاصة يمكن بها التفريق بين الذكور و الإناث و التي تشير إلى إمكانية الكشف بها عن الجنس في شتلات نخيل التمر في المراحل المبكرة للنمو.
و من أجل التأكد من كون تلك المؤشرات مرتبطة بالذكور، تم اختبار تسلسل حزم مختارة عند 582 زوج قاعدي للمؤشر mPdIRD80 في الصنف غنامي اخضر و 926 زوج قاعدي للمؤشرRAJF1R1 للصنف خكري.
كشفت متواليات القواعد النايتروجينية درجة عالية من التشابه مع تسلسل منطقة تحديد الجنس لنخيل التمر Phoenix dactylifera L.
وهي الآن متاحة في بنك الجينات GenBank NCBI تحت الرقم التصنيفي.
MK542703.
1 و MK542705.
1 للصنفين غنامي أخضر و خكري على التوالي.
Abstract EN
Date Palm tree (Phoenix dactylifera L.
), is a dioecious monocotyledonous plant, with separate male and female trees and it is impossible to distinguish tree sex at an early stage until reaches the time of first flowering, which takes about 5-10 years.
Date palm trees are propagated either from seed or vegetative offshoot.
Although propagation with seeds is an economically desirable objective, which enhance breeding programs for genetic improvements of the date palm but it is hard to differentiate the male and female plants at early stages and that makes hard to employ the genetic diversity.
There have been numerous attempts to use the biochemical and molecular markers at an early stage to discriminate among male and female seedling.
Here, we tested sex- specific PCR-based markers that may assist in early gender determination at seedling stage.
Four male varieties (Ghnami Ahmer, Ghnami Akhdhar, Khkry and Khkry-Semesmy) and 4 female varieties (Breem, Khidrawi Mandli, Maktoum and Teberzal) were subjected to PCR amplification using 7 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and 8 Simple Sequences Repeat (SSR) primers to identify sex-linked markers.
Four SSR markers exhibited differential fragments between males and females which indicate marker to detect the sex in date palm seedling in the early stage.
In order to identify the genome segments unique to male, selected bands at 582 pb for mPdIRD80 for Ghnami Akhdhar and at 926 bp for RAJF1R1 for Khkry have been sent for sequencing.
Nucleotide sequences revealed high degree of similarity with Phoenix dactylifera L.
sex-determination region sequence and now are available in GenBank NCBI under the Accession no.
MK542703.
1 and MK542705.
1 for Ghnami Akhdhar and Khkry varieties respectively.
American Psychological Association (APA)
Yusuf, Shadha Ayid& Ulwan, Ata Allah Ibrahim& Hatim, Layth Abd al-Karim& Ibrahim, Hamzah Abd. 2020. Determination of Iraqi date palms based on DNA markers. Basrah Journal for Date Palm Research،Vol. 19, no. 1, pp.18-30.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971755
Modern Language Association (MLA)
Ibrahim, Hamzah Abd…[et al.]. Determination of Iraqi date palms based on DNA markers. Basrah Journal for Date Palm Research Vol. 19, no. 1 (2020), pp.18-30.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971755
American Medical Association (AMA)
Yusuf, Shadha Ayid& Ulwan, Ata Allah Ibrahim& Hatim, Layth Abd al-Karim& Ibrahim, Hamzah Abd. Determination of Iraqi date palms based on DNA markers. Basrah Journal for Date Palm Research. 2020. Vol. 19, no. 1, pp.18-30.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-971755
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
Includes bibliographical references : p. 27-29
Record ID
BIM-971755
