In silico characterization of a cyclin dependent kinase-A (CDKA) and its coding gene in some Oryza species
Other Title(s)
توصيف أحد بروتينات الفسفرة المعتمدة على السيكلين من المجموعة A و الجين الخاص به في بعض أنواع جنس Oryza باستخدام التقنيات الحاسوبية
Joint Authors
Fuad, Ahmad Sayyid
al-Subiai, Sanad Mutlaq
Source
Issue
Vol. 17, Issue 3 (30 Sep. 2020), pp.760-771, 12 p.
Publisher
University of Baghdad College of Science for Women
Publication Date
2020-09-30
Country of Publication
Iraq
No. of Pages
12
Main Subjects
Topics
Abstract AR
يعد الأرز طعاما أساسيا لمعظم سكان العالم.
تساهم بروتينات الفسفرة المعتمدة على السيكلين من المجموعة (CDKA) A في الانتقال عبر المراحل المختلفة لدورة الخلية و كذلك تساهم في تخليق الأمشاج.
و قد هدفت الدراسة الحالية إلى توصيف أحد هذه البروتينات و الجين المسئول عنها في O.
nivara, 0., 0.
glumipatula, 0.
barthii ,0.
glaberrima , 0.
sativa Indica Group O.
punctate, 0.
longistaminata, 0.
meridionalis brachyvntha و o.
rufipogon باستخدام التقنيات الحاسوبية.
كشفت النتائج اختلافات في بعض تتابعات الأحماض الأمينية التي تنظم عمل البروتين محل الدراسة في كلا من O.
longistaminata و brachyantha O.
و ذلك مقارنة بالبروتين ذاته في باقي الأنواع.
افتقد البروتين محل الدراسة في O.
longistaminata أحد تتابعات الأحماض الأمينية المسئولة عن تثبيط عمل البروتين كما لوحظ اختلاف في تتابع الأحماض الأمينية المسئولة عن الارتباط بالسيكلين (PSTAICE بدلا من PSTAIRE ) مما قد يسفر عن توصيف لمجموعة فرعية جديدة متفردة من هذه البروتينات.
في O.
brachyanth تم تسجيل اختلاف في تتابع الأحماض الأمينية بالموضع المسئول عن النشاط المرتبط بلسيكلين.
توصى الدراسة بالاستفادة من الاختلافات سابقة الذكر في التحكم في الانقسام الخلوي و النمو في الأنواع المزروعة من جنس Oryza باستخدام طرق التربية التقليدية او الطرائق الجزيئية.
Abstract EN
Rice (Oryza sativa) is a fundamental food for the majority of world population.
Cyclin Dependent Kinase -A (CDKA) accelerates transition through different stages of cell cycle and contributes in gametes formation.
In the present investigation, a CDKA encoding gene along with the corresponding protein were characterized in O.
sativa Indica Group, O.
glaberrima, O.
barthii, O.
brachyantha, O.
glumipatula, O.
longistaminata, O.
meridionalis, O.
nivara, O.
punctata and O.
rufipogon using in silico analyses.
The results reflected little variation in most species except O.
longistaminata and O.
brachyantha.
Compared with the remaining species, O.
longistaminata lacked a negative regulatory binding site and had a modified cyclin binding site (PSTAICE instead of PSTAIRE) that may lead to future characterization of a new distinct subclass of CDKAs.
O.
brachyantha had a modified SUC / CKS (suppressor of CDC2 / cyclin dependentkinase regulatory subunit)-binding motif.
The observed variations can be exploited through traditional breeding or molecular approaches to manipulate cell division and growth of cultivated Oryza species.
American Psychological Association (APA)
Fuad, Ahmad Sayyid& al-Subiai, Sanad Mutlaq. 2020. In silico characterization of a cyclin dependent kinase-A (CDKA) and its coding gene in some Oryza species. Baghdad Science Journal،Vol. 17, no. 3, pp.760-771.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-976745
Modern Language Association (MLA)
Fuad, Ahmad Sayyid& al-Subiai, Sanad Mutlaq. In silico characterization of a cyclin dependent kinase-A (CDKA) and its coding gene in some Oryza species. Baghdad Science Journal Vol. 17, no. 3 (2020), pp.760-771.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-976745
American Medical Association (AMA)
Fuad, Ahmad Sayyid& al-Subiai, Sanad Mutlaq. In silico characterization of a cyclin dependent kinase-A (CDKA) and its coding gene in some Oryza species. Baghdad Science Journal. 2020. Vol. 17, no. 3, pp.760-771.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-976745
Data Type
Journal Articles
Language
English
Notes
يتضمن مراجع ببليوجرافية : ص. 769-770
Record ID
BIM-976745
