![](/images/graphics-bg.png)
Identifying Interacting Genetic Variations by Fish-Swarm Logic Regression
المؤلفون المشاركون
Zhang, Xuanping
Wang, Jiayin
Yang, Aiyuan
Yan, Chunxia
Zhu, Feng
Zhao, Zhongmeng
Cao, Zhi
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-08-05
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Understanding associations between genotypes and complex traits is a fundamental problem in human genetics.
A major open problem in mapping phenotypes is that of identifying a set of interacting genetic variants, which might contribute to complex traits.
Logic regression (LR) is a powerful multivariant association tool.
Several LR-based approaches have been successfully applied to different datasets.
However, these approaches are not adequate with regard to accuracy and efficiency.
In this paper, we propose a new LR-based approach, called fish-swarm logic regression (FSLR), which improves the logic regression process by incorporating swarm optimization.
In our approach, a school of fish agents are conducted in parallel.
Each fish agent holds a regression model, while the school searches for better models through various preset behaviors.
A swarm algorithm improves the accuracy and the efficiency by speeding up the convergence and preventing it from dropping into local optimums.
We apply our approach on a real screening dataset and a series of simulation scenarios.
Compared to three existing LR-based approaches, our approach outperforms them by having lower type I and type II error rates, being able to identify more preset causal sites, and performing at faster speeds.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhang, Xuanping& Wang, Jiayin& Yang, Aiyuan& Yan, Chunxia& Zhu, Feng& Zhao, Zhongmeng…[et al.]. 2013. Identifying Interacting Genetic Variations by Fish-Swarm Logic Regression. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004624
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhang, Xuanping…[et al.]. Identifying Interacting Genetic Variations by Fish-Swarm Logic Regression. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004624
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhang, Xuanping& Wang, Jiayin& Yang, Aiyuan& Yan, Chunxia& Zhu, Feng& Zhao, Zhongmeng…[et al.]. Identifying Interacting Genetic Variations by Fish-Swarm Logic Regression. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004624
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1004624
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)