An Alternative Approach to Protein Folding
المؤلفون المشاركون
Kang, Yeona
Fortmann, Charles M.
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-02
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A diffusion theory-based, all-physical ab initio protein folding simulation is described and applied.
The model is based upon the drift and diffusion of protein substructures relative to one another in the multiple energy fields present.
Without templates or statistical inputs, the simulations were run at physiologic and ambient temperatures (including pH).
Around 100 protein secondary structures were surveyed, and twenty tertiary structures were determined.
Greater than 70% of the secondary core structures with over 80% alpha helices were correctly identified on protein ranging from 30 to 200 amino-acid sequence.
The drift-diffusion model predicted tertiary structures with RMSD values in the 3–5 Angstroms range for proteins ranging 30 to 150 amino acids.
These predictions are among the best for an all ab initio protein simulation.
Simulations could be run entirely on a desktop computer in minutes; however, more accurate tertiary structures were obtained using molecular dynamic energy relaxation.
The drift-diffusion model generated realistic energy versus time traces.
Rapid secondary structures followed by a slow compacting towards lower energy tertiary structures occurred after an initial incubation period in agreement with observations.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kang, Yeona& Fortmann, Charles M.. 2013. An Alternative Approach to Protein Folding. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004648
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kang, Yeona& Fortmann, Charles M.. An Alternative Approach to Protein Folding. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004648
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kang, Yeona& Fortmann, Charles M.. An Alternative Approach to Protein Folding. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004648
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1004648
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر