![](/images/graphics-bg.png)
Evaluating Phylogenetic Informativeness as a Predictor of Phylogenetic Signal for Metazoan, Fungal, and Mammalian Phylogenomic Data Sets
المؤلفون المشاركون
López-Giráldez, Francesc
Moeller, Andrew H.
Townsend, Jeffrey P.
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-06-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Phylogenetic research is often stymied by selection of a marker that leads to poor phylogenetic resolution despite considerable cost and effort.
Profiles of phylogenetic informativeness provide a quantitative measure for prioritizing gene sampling to resolve branching order in a particular epoch.
To evaluate the utility of these profiles, we analyzed phylogenomic data sets from metazoans, fungi, and mammals, thus encompassing diverse time scales and taxonomic groups.
We also evaluated the utility of profiles created based on simulated data sets.
We found that genes selected via their informativeness dramatically outperformed haphazard sampling of markers.
Furthermore, our analyses demonstrate that the original phylogenetic informativeness method can be extended to trees with more than four taxa.
Thus, although the method currently predicts phylogenetic signal without specifically accounting for the misleading effects of stochastic noise, it is robust to the effects of homoplasy.
The phylogenetic informativeness rankings obtained will allow other researchers to select advantageous genes for future studies within these clades, maximizing return on effort and investment.
Genes identified might also yield efficient experimental designs for phylogenetic inference for many sister clades and outgroup taxa that are closely related to the diverse groups of organisms analyzed.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
López-Giráldez, Francesc& Moeller, Andrew H.& Townsend, Jeffrey P.. 2013. Evaluating Phylogenetic Informativeness as a Predictor of Phylogenetic Signal for Metazoan, Fungal, and Mammalian Phylogenomic Data Sets. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004738
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
López-Giráldez, Francesc…[et al.]. Evaluating Phylogenetic Informativeness as a Predictor of Phylogenetic Signal for Metazoan, Fungal, and Mammalian Phylogenomic Data Sets. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004738
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
López-Giráldez, Francesc& Moeller, Andrew H.& Townsend, Jeffrey P.. Evaluating Phylogenetic Informativeness as a Predictor of Phylogenetic Signal for Metazoan, Fungal, and Mammalian Phylogenomic Data Sets. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1004738
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1004738
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)