Increasing Affinity of Interferon-γ Receptor 1 to Interferon-γ by Computer-Aided Design
المؤلفون المشاركون
Schneider, B.
Mikulecký, Pavel
Černý, Jiří
Biedermannová, Lada
Petroková, Hana
Kuchař, Milan
Vondrášek, Jiří
Malý, Petr
Šebo, Peter
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-10-02
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
We describe a computer-based protocol to design protein mutations increasing binding affinity between ligand and its receptor.
The method was applied to mutate interferon-γ receptor 1 (IFN-γ-Rx) to increase its affinity to natural ligand IFN-γ, protein important for innate immunity.
We analyzed all four available crystal structures of the IFN-γ-Rx/IFN-γ complex to identify 40 receptor residues forming the interface with IFN-γ.
For these 40 residues, we performed computational mutation analysis by substituting each of the interface receptor residues by the remaining standard amino acids.
The corresponding changes of the free energy were calculated by a protocol consisting of FoldX and molecular dynamics calculations.
Based on the computed changes of the free energy and on sequence conservation criteria obtained by the analysis of 32 receptor sequences from 19 different species, we selected 14 receptor variants predicted to increase the receptor affinity to IFN-γ.
These variants were expressed as recombinant proteins in Escherichia coli, and their affinities to IFN-γ were determined experimentally by surface plasmon resonance (SPR).
The SPR measurements showed that the simple computational protocol succeeded in finding two receptor variants with affinity to IFN-γ increased about fivefold compared to the wild-type receptor.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Mikulecký, Pavel& Černý, Jiří& Biedermannová, Lada& Petroková, Hana& Kuchař, Milan& Vondrášek, Jiří…[et al.]. 2013. Increasing Affinity of Interferon-γ Receptor 1 to Interferon-γ by Computer-Aided Design. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005034
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Mikulecký, Pavel…[et al.]. Increasing Affinity of Interferon-γ Receptor 1 to Interferon-γ by Computer-Aided Design. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005034
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Mikulecký, Pavel& Černý, Jiří& Biedermannová, Lada& Petroková, Hana& Kuchař, Milan& Vondrášek, Jiří…[et al.]. Increasing Affinity of Interferon-γ Receptor 1 to Interferon-γ by Computer-Aided Design. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005034
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1005034
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر