Streaming Support for Data Intensive Cloud-Based Sequence Analysis
المؤلفون المشاركون
Issa, Shadi A.
Kienzler, Romeo
El-Kalioby, Mohamed
Tonellato, Peter J.
Wall, Dennis
Bruggmann, Rémy
Abouelhoda, Mohamed
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-16، 16ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-04-24
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
16
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Cloud computing provides a promising solution to the genomics data deluge problem resulting from the advent of next-generation sequencing (NGS) technology.
Based on the concepts of “resources-on-demand” and “pay-as-you-go”, scientists with no or limited infrastructure can have access to scalable and cost-effective computational resources.
However, the large size of NGS data causes a significant data transfer latency from the client’s site to the cloud, which presents a bottleneck for using cloud computing services.
In this paper, we provide a streaming-based scheme to overcome this problem, where the NGS data is processed while being transferred to the cloud.
Our scheme targets the wide class of NGS data analysis tasks, where the NGS sequences can be processed independently from one another.
We also provide the elastream package that supports the use of this scheme with individual analysis programs or with workflow systems.
Experiments presented in this paper show that our solution mitigates the effect of data transfer latency and saves both time and cost of computation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Issa, Shadi A.& Kienzler, Romeo& El-Kalioby, Mohamed& Tonellato, Peter J.& Wall, Dennis& Bruggmann, Rémy…[et al.]. 2013. Streaming Support for Data Intensive Cloud-Based Sequence Analysis. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005122
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Issa, Shadi A.…[et al.]. Streaming Support for Data Intensive Cloud-Based Sequence Analysis. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005122
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Issa, Shadi A.& Kienzler, Romeo& El-Kalioby, Mohamed& Tonellato, Peter J.& Wall, Dennis& Bruggmann, Rémy…[et al.]. Streaming Support for Data Intensive Cloud-Based Sequence Analysis. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005122
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1005122
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر