Mixing Energy Models in Genetic Algorithms for On-Lattice Protein Structure Prediction
المؤلفون المشاركون
Rashid, Mahmood A.
Newton, M. A. Hakim
Hoque, Md Tamjidul
Sattar, Abdul
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-15، 15ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-25
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
15
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Protein structure prediction (PSP) is computationally a very challenging problem.
The challenge largely comes from the fact that the energy function that needs to be minimised in order to obtain the native structure of a given protein is not clearly known.
A high resolution 20×20 energy model could better capture the behaviour of the actual energy function than a low resolution energy model such as hydrophobic polar.
However, the fine grained details of the high resolution interaction energy matrix are often not very informative for guiding the search.
In contrast, a low resolution energy model could effectively bias the search towards certain promising directions.
In this paper, we develop a genetic algorithm that mainly uses a high resolution energy model for protein structure evaluation but uses a low resolution HP energy model in focussing the search towards exploring structures that have hydrophobic cores.
We experimentally show that this mixing of energy models leads to significant lower energy structures compared to the state-of-the-art results.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Rashid, Mahmood A.& Newton, M. A. Hakim& Hoque, Md Tamjidul& Sattar, Abdul. 2013. Mixing Energy Models in Genetic Algorithms for On-Lattice Protein Structure Prediction. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005425
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Rashid, Mahmood A.…[et al.]. Mixing Energy Models in Genetic Algorithms for On-Lattice Protein Structure Prediction. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005425
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Rashid, Mahmood A.& Newton, M. A. Hakim& Hoque, Md Tamjidul& Sattar, Abdul. Mixing Energy Models in Genetic Algorithms for On-Lattice Protein Structure Prediction. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1005425
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1005425
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر