Prediction and Analysis of Retinoblastoma Related Genes through Gene Ontology and KEGG
المؤلفون المشاركون
Zhang, Jian
Huang, Tao
Li, Zhen
Liu, Lin
Chen, Lei
Jiang, Min
Li, Bi-Qing
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-08-07
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
One of the most important and challenging problems in biomedicine is how to predict the cancer related genes.
Retinoblastoma (RB) is the most common primary intraocular malignancy usually occurring in childhood.
Early detection of RB could reduce the morbidity and promote the probability of disease-free survival.
Therefore, it is of great importance to identify RB genes.
In this study, we developed a computational method to predict RB related genes based on Dagging, with the maximum relevance minimum redundancy (mRMR) method followed by incremental feature selection (IFS).
119 RB genes were compiled from two previous RB related studies, while 5,500 non-RB genes were randomly selected from Ensemble genes.
Ten datasets were constructed based on all these RB and non-RB genes.
Each gene was encoded with a 13,126-dimensional vector including 12,887 Gene Ontology enrichment scores and 239 KEGG enrichment scores.
Finally, an optimal feature set including 1061 GO terms and 8 KEGG pathways was obtained.
Analysis showed that these features were closely related to RB.
It is anticipated that the method can be applied to predict the other cancer related genes as well.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Zhen& Li, Bi-Qing& Jiang, Min& Chen, Lei& Zhang, Jian& Liu, Lin…[et al.]. 2013. Prediction and Analysis of Retinoblastoma Related Genes through Gene Ontology and KEGG. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030344
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Zhen…[et al.]. Prediction and Analysis of Retinoblastoma Related Genes through Gene Ontology and KEGG. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030344
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Zhen& Li, Bi-Qing& Jiang, Min& Chen, Lei& Zhang, Jian& Liu, Lin…[et al.]. Prediction and Analysis of Retinoblastoma Related Genes through Gene Ontology and KEGG. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030344
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1030344
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر