An Accurate Method for Prediction of Protein-Ligand Binding Site on Protein Surface Using SVM and Statistical Depth Function
المؤلفون المشاركون
Ruan, Jishou
Wang, Kui
Gao, Jianzhao
Shen, Shiyi
Tuszynski, Jack A.
Hu, Gang
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-09-30
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Since proteins carry out their functions through interactions with other molecules, accurately identifying the protein-ligand binding site plays an important role in protein functional annotation and rational drug discovery.
In the past two decades, a lot of algorithms were present to predict the protein-ligand binding site.
In this paper, we introduce statistical depth function to define negative samples and propose an SVM-based method which integrates sequence and structural information to predict binding site.
The results show that the present method performs better than the existent ones.
The accuracy, sensitivity, and specificity on training set are 77.55%, 56.15%, and 87.96%, respectively; on the independent test set, the accuracy, sensitivity, and specificity are 80.36%, 53.53%, and 92.38%, respectively.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Kui& Gao, Jianzhao& Shen, Shiyi& Tuszynski, Jack A.& Ruan, Jishou& Hu, Gang. 2013. An Accurate Method for Prediction of Protein-Ligand Binding Site on Protein Surface Using SVM and Statistical Depth Function. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030522
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Kui…[et al.]. An Accurate Method for Prediction of Protein-Ligand Binding Site on Protein Surface Using SVM and Statistical Depth Function. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030522
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Kui& Gao, Jianzhao& Shen, Shiyi& Tuszynski, Jack A.& Ruan, Jishou& Hu, Gang. An Accurate Method for Prediction of Protein-Ligand Binding Site on Protein Surface Using SVM and Statistical Depth Function. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030522
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1030522
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر