![](/images/graphics-bg.png)
Prediction of Substrate-Enzyme-Product Interaction Based on Molecular Descriptors and Physicochemical Properties
المؤلفون المشاركون
Huang, Tao
Niu, Bing
Zheng, Linfeng
Wang, Xueyuan
Chen, Fuxue
Zhang, Yuhui
Huang, Guohua
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-12-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
It is important to correctly and efficiently predict the interaction of substrate-enzyme and to predict their product in metabolic pathway.
In this work, a novel approach was introduced to encode substrate/product and enzyme molecules with molecular descriptors and physicochemical properties, respectively.
Based on this encoding method, KNN was adopted to build the substrate-enzyme-product interaction network.
After selecting the optimal features that are able to represent the main factors of substrate-enzyme-product interaction in our prediction, totally 160 features out of 290 features were attained which can be clustered into ten categories: elemental analysis, geometry, chemistry, amino acid composition, predicted secondary structure, hydrophobicity, polarizability, solvent accessibility, normalized van der Waals volume, and polarity.
As a result, our predicting model achieved an MCC of 0.423 and an overall prediction accuracy of 89.1% for 10-fold cross-validation test.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Niu, Bing& Huang, Guohua& Zheng, Linfeng& Wang, Xueyuan& Chen, Fuxue& Zhang, Yuhui…[et al.]. 2013. Prediction of Substrate-Enzyme-Product Interaction Based on Molecular Descriptors and Physicochemical Properties. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030773
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Niu, Bing…[et al.]. Prediction of Substrate-Enzyme-Product Interaction Based on Molecular Descriptors and Physicochemical Properties. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030773
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Niu, Bing& Huang, Guohua& Zheng, Linfeng& Wang, Xueyuan& Chen, Fuxue& Zhang, Yuhui…[et al.]. Prediction of Substrate-Enzyme-Product Interaction Based on Molecular Descriptors and Physicochemical Properties. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1030773
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1030773
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)