![](/images/graphics-bg.png)
A Genome-Wide Analysis of RNA Pseudoknots That Stimulate Efficient −1 Ribosomal Frameshifting or Readthrough in Animal Viruses
المؤلفون المشاركون
Huang, Xiaolan
Du, Zhihua
Cheng, Qiang
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-15، 15ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-11-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
15
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Programmed −1 ribosomal frameshifting (PRF) and stop codon readthrough are two translational recoding mechanisms utilized by some RNA viruses to express their structural and enzymatic proteins at a defined ratio.
Efficient recoding usually requires an RNA pseudoknot located several nucleotides downstream from the recoding site.
To assess the strategic importance of the recoding pseudoknots, we have carried out a large scale genome-wide analysis in which we used an in-house developed program to detect all possible H-type pseudoknots within the genomic mRNAs of 81 animal viruses.
Pseudoknots are detected downstream from ~85% of the recoding sites, including many previously unknown pseudoknots.
~78% of the recoding pseudoknots are the most stable pseudoknot within the viral genomes.
However, they are not as strong as some designed pseudoknots that exhibit roadblocking effect on the translating ribosome.
Strong roadblocking pseudoknots are not detected within the viral genomes.
These results indicate that the decoding pseudoknots have evolved to possess optimal stability for efficient recoding.
We also found that the sequence at the gag-pol frameshift junction of HIV1 harbors potential elaborated pseudoknots encompassing the frameshift site.
A novel mechanism is proposed for possible involvement of the elaborated pseudoknots in the HIV1 PRF event.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Huang, Xiaolan& Cheng, Qiang& Du, Zhihua. 2013. A Genome-Wide Analysis of RNA Pseudoknots That Stimulate Efficient −1 Ribosomal Frameshifting or Readthrough in Animal Viruses. BioMed Research International،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1031169
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Huang, Xiaolan…[et al.]. A Genome-Wide Analysis of RNA Pseudoknots That Stimulate Efficient −1 Ribosomal Frameshifting or Readthrough in Animal Viruses. BioMed Research International No. 2013 (2013), pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1031169
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Huang, Xiaolan& Cheng, Qiang& Du, Zhihua. A Genome-Wide Analysis of RNA Pseudoknots That Stimulate Efficient −1 Ribosomal Frameshifting or Readthrough in Animal Viruses. BioMed Research International. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1031169
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1031169
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)