![](/images/graphics-bg.png)
Extracting Physicochemical Features to Predict Protein Secondary Structure
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-05-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
We propose a protein secondary structure prediction method based on position-specific scoring matrix (PSSM) profiles and four physicochemical features including conformation parameters, net charges, hydrophobic, and side chain mass.
First, the SVM with the optimal window size and the optimal parameters of the kernel function is found.
Then, we train the SVM using the PSSM profiles generated from PSI-BLAST and the physicochemical features extracted from the CB513 data set.
Finally, we use the filter to refine the predicted results from the trained SVM.
For all the performance measures of our method, Q3 reaches 79.52, SOV94 reaches 86.10, and SOV99 reaches 74.60; all the measures are higher than those of the SVMpsi method and the SVMfreq method.
This validates that considering these physicochemical features in predicting protein secondary structure would exhibit better performances.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Huang, Yin-Fu& Chen, Shu-Ying. 2013. Extracting Physicochemical Features to Predict Protein Secondary Structure. The Scientific World Journal،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1032800
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Huang, Yin-Fu& Chen, Shu-Ying. Extracting Physicochemical Features to Predict Protein Secondary Structure. The Scientific World Journal No. 2013 (2013), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1032800
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Huang, Yin-Fu& Chen, Shu-Ying. Extracting Physicochemical Features to Predict Protein Secondary Structure. The Scientific World Journal. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1032800
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1032800
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)