Survival Analysis by Penalized Regression and Matrix Factorization
المؤلفون المشاركون
Lai, Yeuntyng
Hayashida, Morihiro
Akutsu, Tatsuya
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-04-23
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Because every disease has its unique survival pattern, it is necessaryto find a suitable model to simulate followups.
DNA microarray is a useful technique to detect thousands of gene expressions at one time and is usually employed to classify different types of cancer.
We propose combination methods of penalized regression models and nonnegative matrixfactorization (NMF) for predicting survival.
We tried L1- (lasso), L2- (ridge), and L1-L2 combined (elastic net) penalized regression for diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) patients'microarray data and found that L1-L2 combined method predicts survival best with the smallest logrank P value.
Furthermore, 80% of selected genes have been reported to correlate with carcinogenesis or lymphoma.
Through NMF we found that DLBCL patients can be divided into 4 groups clearly, and it implies that DLBCL may have 4 subtypes which have a little different survival patterns.
Next we excluded some patients who were indicated hard to classify in NMF and executed three penalized regression models again.
We found that the performance of survival prediction has been improved with lower logrank P values.
Therefore, we conclude that after preselection of patients by NMF, penalized regression models can predict DLBCL patients' survival successfully.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Lai, Yeuntyng& Hayashida, Morihiro& Akutsu, Tatsuya. 2013. Survival Analysis by Penalized Regression and Matrix Factorization. The Scientific World Journal،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033146
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Lai, Yeuntyng…[et al.]. Survival Analysis by Penalized Regression and Matrix Factorization. The Scientific World Journal No. 2013 (2013), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033146
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Lai, Yeuntyng& Hayashida, Morihiro& Akutsu, Tatsuya. Survival Analysis by Penalized Regression and Matrix Factorization. The Scientific World Journal. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033146
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1033146
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر