Comparison of Nasal Epithelial Smoking-Induced Gene Expression on Affymetrix Exon 1.0 and Gene 1.0 ST Arrays
المؤلفون المشاركون
Zhang, Xiaoling
Lenburg, Marc E.
Spira, Avrum
المصدر
العدد
المجلد 2013، العدد 2013 (31 ديسمبر/كانون الأول 2013)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2013-02-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
We have previously defined the impact of tobacco smoking on nasal epithelium gene expression using Affymetrix Exon 1.0 ST arrays.
In this paper, we compared the performance of the Affymetrix GeneChip Human Gene 1.0 ST array with the Human Exon 1.0 ST array for detecting nasal smoking-related gene expression changes.
RNA collected from the nasal epithelium of five current smokers and five never smokers was hybridized to both arrays.
While the intersample correlation within each array platform was relatively higher in the Gene array than that in the Exon array, the majority of the genes most changed by smoking were tightly correlated between platforms.
Although neither array dataset was powered to detect differentially expressed genes (DEGs) at a false discovery rate (FDR) <0.05, we identified more DEGs than expected by chance using the Gene ST array.
These findings suggest that while both platforms show a high degree of correlation for detecting smoking-induced differential gene expression changes, the Gene ST array may be a more cost-effective platform in a clinical setting for gene-level genomewide expression profiling and an effective tool for exploring the host response to cigarette smoking and other inhaled toxins.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhang, Xiaoling& Lenburg, Marc E.& Spira, Avrum. 2013. Comparison of Nasal Epithelial Smoking-Induced Gene Expression on Affymetrix Exon 1.0 and Gene 1.0 ST Arrays. The Scientific World Journal،Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033481
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhang, Xiaoling…[et al.]. Comparison of Nasal Epithelial Smoking-Induced Gene Expression on Affymetrix Exon 1.0 and Gene 1.0 ST Arrays. The Scientific World Journal No. 2013 (2013), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033481
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhang, Xiaoling& Lenburg, Marc E.& Spira, Avrum. Comparison of Nasal Epithelial Smoking-Induced Gene Expression on Affymetrix Exon 1.0 and Gene 1.0 ST Arrays. The Scientific World Journal. 2013. Vol. 2013, no. 2013, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1033481
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1033481
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر