Molecular Phylogeny and Predicted 3D Structure of Plant beta-D-N-Acetylhexosaminidase
المؤلفون المشاركون
Hossain, Md. Anowar
Roslan, Hairul Azman
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-07-20
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
beta-D-N-Acetylhexosaminidase, a family 20 glycosyl hydrolase, catalyzes the removal of β-1,4-linked N-acetylhexosamine residues from oligosaccharides and their conjugates.
We constructed phylogenetic tree of β-hexosaminidases to analyze the evolutionary history and predicted functions of plant hexosaminidases.
Phylogenetic analysis reveals the complex history of evolution of plant β-hexosaminidase that can be described by gene duplication events.
The 3D structure of tomato β-hexosaminidase (β-Hex-Sl) was predicted by homology modeling using 1now as a template.
Structural conformity studies of the best fit model showed that more than 98% of the residues lie inside the favoured and allowed regions where only 0.9% lie in the unfavourable region.
Predicted 3D structure contains 531 amino acids residues with glycosyl hydrolase20b domain-I and glycosyl hydrolase20 superfamily domain-II including the (β/α)8 barrel in the central part.
The α and β contents of the modeled structure were found to be 33.3% and 12.2%, respectively.
Eleven amino acids were found to be involved in ligand-binding site; Asp(330) and Glu(331) could play important roles in enzyme-catalyzed reactions.
The predicted model provides a structural framework that can act as a guide to develop a hypothesis for β-Hex-Sl mutagenesis experiments for exploring the functions of this class of enzymes in plant kingdom.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hossain, Md. Anowar& Roslan, Hairul Azman. 2014. Molecular Phylogeny and Predicted 3D Structure of Plant beta-D-N-Acetylhexosaminidase. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048652
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hossain, Md. Anowar& Roslan, Hairul Azman. Molecular Phylogeny and Predicted 3D Structure of Plant beta-D-N-Acetylhexosaminidase. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048652
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hossain, Md. Anowar& Roslan, Hairul Azman. Molecular Phylogeny and Predicted 3D Structure of Plant beta-D-N-Acetylhexosaminidase. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048652
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1048652
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر