An Empirical Study of Different Approaches for Protein Classification
المؤلفون المشاركون
Brahnam, Sheryl
Nanni, Loris
Lumini, Alessandra
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-17، 17ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-06-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
17
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Many domains would benefit from reliable and efficient systems for automatic protein classification.
An area of particular interest in recent studies on automatic protein classification is the exploration of new methods for extracting features from a protein that work well for specific problems.
These methods, however, are not generalizable and have proven useful in only a few domains.
Our goal is to evaluate several feature extraction approaches for representing proteins by testing them across multiple datasets.
Different types of protein representations are evaluated: those starting from the position specific scoring matrix of the proteins (PSSM), those derived from the amino-acid sequence, two matrix representations, and features taken from the 3D tertiary structure of the protein.
We also test new variants of proteins descriptors.
We develop our system experimentally by comparing and combining different descriptors taken from the protein representations.
Each descriptor is used to train a separate support vector machine (SVM), and the results are combined by sum rule.
Some stand-alone descriptors work well on some datasets but not on others.
Through fusion, the different descriptors provide a performance that works well across all tested datasets, in some cases performing better than the state-of-the-art.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Nanni, Loris& Lumini, Alessandra& Brahnam, Sheryl. 2014. An Empirical Study of Different Approaches for Protein Classification. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-17.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048831
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Nanni, Loris…[et al.]. An Empirical Study of Different Approaches for Protein Classification. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-17.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048831
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Nanni, Loris& Lumini, Alessandra& Brahnam, Sheryl. An Empirical Study of Different Approaches for Protein Classification. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-17.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1048831
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1048831
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر