Protein-Protein Interactions Prediction Based on Iterative Clique Extension with Gene Ontology Filtering
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-01-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Cliques (maximal complete subnets) in protein-protein interaction (PPI) network are an important resource used to analyze protein complexes and functional modules.
Clique-based methods of predicting PPI complement the data defection from biological experiments.
However, clique-based predicting methods only depend on the topology of network.
The false-positive and false-negative interactions in a network usually interfere with prediction.
Therefore, we propose a method combining clique-based method of prediction and gene ontology (GO) annotations to overcome the shortcoming and improve the accuracy of predictions.
According to different GO correcting rules, we generate two predicted interaction sets which guarantee the quality and quantity of predicted protein interactions.
The proposed method is applied to the PPI network from the Database of Interacting Proteins (DIP) and most of the predicted interactions are verified by another biological database, BioGRID.
The predicted protein interactions are appended to the original protein network, which leads to clique extension and shows the significance of biological meaning.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yang, Lei& Tang, Xianglong. 2014. Protein-Protein Interactions Prediction Based on Iterative Clique Extension with Gene Ontology Filtering. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049961
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yang, Lei& Tang, Xianglong. Protein-Protein Interactions Prediction Based on Iterative Clique Extension with Gene Ontology Filtering. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049961
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yang, Lei& Tang, Xianglong. Protein-Protein Interactions Prediction Based on Iterative Clique Extension with Gene Ontology Filtering. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1049961
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1049961
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر