Mining 3D Patterns from Gene Expression Temporal Data: A New Tricluster Evaluation Measure
المؤلفون المشاركون
Gutiérrez-Avilés, David
Rubio-Escudero, Cristina
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-16، 16ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-03-31
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
16
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Microarrays have revolutionized biotechnological research.
The analysis of new data generated represents a computational challenge due to the characteristics of these data.
Clustering techniques are applied to create groups of genes that exhibit a similar behavior.
Biclustering emerges as a valuable tool for microarray data analysis since it relaxes the constraints for grouping, allowing genes to be evaluated only under a subset of the conditions.
However, if a third dimension appears in the data, triclustering is the appropriate tool for the analysis.
This occurs in longitudinal experiments in which the genes are evaluated under conditions at several time points.
All clustering, biclustering, and triclustering techniques guide their search for solutions by a measure that evaluates the quality of clusters.
We present an evaluation measure for triclusters called Mean Square Residue 3D.
This measure is based on the classic biclustering measure Mean Square Residue.
Mean Square Residue 3D has been applied to both synthetic and real data and it has proved to be capable of extracting groups of genes with homogeneous patterns in subsets of conditions and times, and these groups have shown a high correlation level and they are also related to their functional annotations extracted from the Gene Ontology project.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Gutiérrez-Avilés, David& Rubio-Escudero, Cristina. 2014. Mining 3D Patterns from Gene Expression Temporal Data: A New Tricluster Evaluation Measure. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1050389
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Gutiérrez-Avilés, David& Rubio-Escudero, Cristina. Mining 3D Patterns from Gene Expression Temporal Data: A New Tricluster Evaluation Measure. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1050389
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Gutiérrez-Avilés, David& Rubio-Escudero, Cristina. Mining 3D Patterns from Gene Expression Temporal Data: A New Tricluster Evaluation Measure. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1050389
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1050389
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر