Global Genome Comparative Analysis Reveals Insights of Resistome and Life-Style Adaptation of Pseudomonas putida Strain T2-2 in Oral Cavity
المؤلفون المشاركون
Yin, Wai-Fong
Chan, Kok-Gan
Chan, Xin Yue
Chua, Kah Ooi
How, Kah Yan
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-11-10
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Most Pseudomonas putida strains are environmental microorganisms exhibiting a wide range of metabolic capability but certain strains have been reported as rare opportunistic pathogens and some emerged as multidrug resistant P.
putida.
This study aimed to assess the drug resistance profile of, via whole genome analysis, P.
putida strain T2-2 isolated from oral cavity.
At the same time, we also compared the nonenvironmental strain with environmentally isolated P.
putida.
In silico comparative genome analysis with available reference strains of P.
putida shows that T2-2 has lesser gene counts on carbohydrate and aromatic compounds metabolisms, which suggested its little versatility.
The detection of its edd gene also suggested T2-2’s catabolism of glucose via ED pathway instead of EMP pathway.
On the other hand, its drug resistance profile was observed via in silico gene prediction and most of the genes found were in agreement with drug-susceptibility testing in laboratory by automated VITEK 2.
In addition, the finding of putative genes of multidrug resistance efflux pump and ATP-binding cassette transporters in this strain suggests a multidrug resistant phenotype.
In summary, it is believed that multiple metabolic characteristics and drug resistance in P.
putida strain T2-2 helped in its survival in human oral cavity.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Chan, Xin Yue& Chua, Kah Ooi& How, Kah Yan& Yin, Wai-Fong& Chan, Kok-Gan. 2014. Global Genome Comparative Analysis Reveals Insights of Resistome and Life-Style Adaptation of Pseudomonas putida Strain T2-2 in Oral Cavity. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051645
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Chan, Xin Yue…[et al.]. Global Genome Comparative Analysis Reveals Insights of Resistome and Life-Style Adaptation of Pseudomonas putida Strain T2-2 in Oral Cavity. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051645
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Chan, Xin Yue& Chua, Kah Ooi& How, Kah Yan& Yin, Wai-Fong& Chan, Kok-Gan. Global Genome Comparative Analysis Reveals Insights of Resistome and Life-Style Adaptation of Pseudomonas putida Strain T2-2 in Oral Cavity. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051645
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1051645
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر