![](/images/graphics-bg.png)
Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools
المؤلفون المشاركون
Mateo, Jordi
Vilaplana, Jordi
Solsona, Francesc
Teixido, Ivan
Usié, Anabel
Karathia, Hiren
Alves, Rui
المصدر
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-08-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Our group developed two biological applications, Biblio-MetReS and Homol-MetReS, accessing the same database of organisms with annotated genes.
Biblio-MetReS is a data-mining application that facilitates the reconstruction of molecular networks based on automated text-mining analysis of published scientific literature.
Homol-MetReS allows functional (re)annotation of proteomes, to properly identify both the individual proteins involved in the process(es) of interest and their function.
It also enables the sets of proteins involved in the process(es) in different organisms to be compared directly.
The efficiency of these biological applications is directly related to the design of the shared database.
We classified and analyzed the different kinds of access to the database.
Based on this study, we tried to adjust and tune the configurable parameters of the database server to reach the best performance of the communication data link to/from the database system.
Different database technologies were analyzed.
We started the study with a public relational SQL database, MySQL.
Then, the same database was implemented by a MapReduce-based database named HBase.
The results indicated that the standard configuration of MySQL gives an acceptable performance for low or medium size databases.
Nevertheless, tuning database parameters can greatly improve the performance and lead to very competitive runtimes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Vilaplana, Jordi& Solsona, Francesc& Teixido, Ivan& Usié, Anabel& Karathia, Hiren& Alves, Rui…[et al.]. 2014. Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools. The Scientific World Journal،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051790
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Vilaplana, Jordi…[et al.]. Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools. The Scientific World Journal No. 2014 (2014), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051790
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Vilaplana, Jordi& Solsona, Francesc& Teixido, Ivan& Usié, Anabel& Karathia, Hiren& Alves, Rui…[et al.]. Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools. The Scientific World Journal. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1051790
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1051790
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)