ProSim: A Method for Prioritizing Disease Genes Based on Protein Proximity and Disease Similarity
المؤلفون المشاركون
Sheng, Yu
Ganegoda, Gamage Upeksha
Wang, Jianxin
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-08-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Predicting disease genes for a particular genetic disease is very challenging in bioinformatics.
Based on current research studies, this challenge can be tackled via network-based approaches.
Furthermore, it has been highlighted that it is necessary to consider disease similarity along with the protein’s proximity to disease genes in a protein-protein interaction (PPI) network in order to improve the accuracy of disease gene prioritization.
In this study we propose a new algorithm called proximity disease similarity algorithm (ProSim), which takes both of the aforementioned properties into consideration, to prioritize disease genes.
To illustrate the proposed algorithm, we have conducted six case studies, namely, prostate cancer, Alzheimer’s disease, diabetes mellitus type 2, breast cancer, colorectal cancer, and lung cancer.
We employed leave-one-out cross validation, mean enrichment, tenfold cross validation, and ROC curves to evaluate our proposed method and other existing methods.
The results show that our proposed method outperforms existing methods such as PRINCE, RWR, and DADA.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ganegoda, Gamage Upeksha& Sheng, Yu& Wang, Jianxin. 2015. ProSim: A Method for Prioritizing Disease Genes Based on Protein Proximity and Disease Similarity. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054653
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ganegoda, Gamage Upeksha…[et al.]. ProSim: A Method for Prioritizing Disease Genes Based on Protein Proximity and Disease Similarity. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054653
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ganegoda, Gamage Upeksha& Sheng, Yu& Wang, Jianxin. ProSim: A Method for Prioritizing Disease Genes Based on Protein Proximity and Disease Similarity. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1054653
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1054653
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر