![](/images/graphics-bg.png)
MetaRNA-Seq: An Interactive Tool to Browse and Annotate Metadata from RNA-Seq Studies
المؤلفون المشاركون
Kumar, Pankaj
Halama, Anna
Hayat, Shahina
Billing, Anja M.
Gupta, Manish
Yousri, Noha A.
Smith, Gregory M.
Suhre, Karsten
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-08-25
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The number of RNA-Seq studies has grown in recent years.
The design of RNA-Seq studies varies from very simple (e.g., two-condition case-control) to very complicated (e.g., time series involving multiple samples at each time point with separate drug treatments).
Most of these publically available RNA-Seq studies are deposited in NCBI databases, but their metadata are scattered throughout four different databases: Sequence Read Archive (SRA), Biosample, Bioprojects, and Gene Expression Omnibus (GEO).
Although the NCBI web interface is able to provide all of the metadata information, it often requires significant effort to retrieve study- or project-level information by traversing through multiple hyperlinks and going to another page.
Moreover, project- and study-level metadata lack manual or automatic curation by categories, such as disease type, time series, case-control, or replicate type, which are vital to comprehending any RNA-Seq study.
Here we describe “MetaRNA-Seq,” a new tool for interactively browsing, searching, and annotating RNA-Seq metadata with the capability of semiautomatic curation at the study level.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kumar, Pankaj& Halama, Anna& Hayat, Shahina& Billing, Anja M.& Gupta, Manish& Yousri, Noha A.…[et al.]. 2015. MetaRNA-Seq: An Interactive Tool to Browse and Annotate Metadata from RNA-Seq Studies. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055031
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kumar, Pankaj…[et al.]. MetaRNA-Seq: An Interactive Tool to Browse and Annotate Metadata from RNA-Seq Studies. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055031
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kumar, Pankaj& Halama, Anna& Hayat, Shahina& Billing, Anja M.& Gupta, Manish& Yousri, Noha A.…[et al.]. MetaRNA-Seq: An Interactive Tool to Browse and Annotate Metadata from RNA-Seq Studies. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055031
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1055031
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)