![](/images/graphics-bg.png)
Low-Rank and Sparse Matrix Decomposition for GeneticInteraction Data
المؤلفون المشاركون
Wang, Yishu
Yang, Dejie
Deng, Minghua
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-07-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Epistatic miniarray profile (EMAP) studies have enabled the mapping of large-scale genetic interaction networks and generated large amounts of data in model organisms.
One approach to analyze EMAP data is to identify gene modules with densely interacting genes.
In addition, genetic interaction score (S score) reflects the degree of synergizing or mitigating effect of two mutants, which is also informative.
Statistical approaches that exploit both modularity and the pairwise interactions may provide more insight into the underlying biology.
However, the high missing rate in EMAP data hinders the development of such approaches.
To address the above problem, we adopted the matrix decomposition methodology “low-rank and sparse decomposition” (LRSDec) to decompose EMAP data matrix into low-rank part and sparse part.
Results.
LRSDec has been demonstrated as an effective technique for analyzing EMAP data.
We applied a synthetic dataset and an EMAP dataset studying RNA-related processes in Saccharomyces cerevisiae.
Global views of the genetic cross talk between different RNA-related protein complexes and processes have been structured, and novel functions of genes have been predicted.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Yishu& Yang, Dejie& Deng, Minghua. 2015. Low-Rank and Sparse Matrix Decomposition for GeneticInteraction Data. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055965
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Yishu…[et al.]. Low-Rank and Sparse Matrix Decomposition for GeneticInteraction Data. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055965
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Yishu& Yang, Dejie& Deng, Minghua. Low-Rank and Sparse Matrix Decomposition for GeneticInteraction Data. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055965
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1055965
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)