A Meta-Analysis Strategy for Gene Prioritization Using Gene Expression, SNP Genotype, and eQTL Data
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-03-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In order to understand disease pathogenesis, improve medical diagnosis, or discover effective drug targets, it is important to identify significant genes deeply involved in human disease.
For this purpose, many earlier approaches attempted to prioritize candidate genes using gene expression profiles or SNP genotype data, but they often suffer from producing many false-positive results.
To address this issue, in this paper, we propose a meta-analysis strategy for gene prioritization that employs three different genetic resources—gene expression data, single nucleotide polymorphism (SNP) genotype data, and expression quantitative trait loci (eQTL) data—in an integrative manner.
For integration, we utilized an improved technique for the order of preference by similarity to ideal solution (TOPSIS) to combine scores from distinct resources.
This method was evaluated on two publicly available datasets regarding prostate cancer and lung cancer to identify disease-related genes.
Consequently, our proposed strategy for gene prioritization showed its superiority to conventional methods in discovering significant disease-related genes with several types of genetic resources, while making good use of potential complementarities among available resources.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Che, Jingmin& Shin, Miyoung. 2015. A Meta-Analysis Strategy for Gene Prioritization Using Gene Expression, SNP Genotype, and eQTL Data. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055981
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Che, Jingmin& Shin, Miyoung. A Meta-Analysis Strategy for Gene Prioritization Using Gene Expression, SNP Genotype, and eQTL Data. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055981
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Che, Jingmin& Shin, Miyoung. A Meta-Analysis Strategy for Gene Prioritization Using Gene Expression, SNP Genotype, and eQTL Data. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1055981
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1055981
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر