mRMR-ABC: A Hybrid Gene Selection Algorithm for Cancer Classification Using Microarray Gene Expression Profiling
المؤلفون المشاركون
Alshamlan, Hala
Badr, Ghada
Alohali, Yousef
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-15، 15ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-04-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
15
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
An artificial bee colony (ABC) is a relatively recent swarm intelligence optimization approach.
In this paper, we propose the first attempt at applying ABC algorithm in analyzing a microarray gene expression profile.
In addition, we propose an innovative feature selection algorithm, minimum redundancy maximum relevance (mRMR), and combine it with an ABC algorithm, mRMR-ABC, to select informative genes from microarray profile.
The new approach is based on a support vector machine (SVM) algorithm to measure the classification accuracy for selected genes.
We evaluate the performance of the proposed mRMR-ABC algorithm by conducting extensive experiments on six binary and multiclass gene expression microarray datasets.
Furthermore, we compare our proposed mRMR-ABC algorithm with previously known techniques.
We reimplemented two of these techniques for the sake of a fair comparison using the same parameters.
These two techniques are mRMR when combined with a genetic algorithm (mRMR-GA) and mRMR when combined with a particle swarm optimization algorithm (mRMR-PSO).
The experimental results prove that the proposed mRMR-ABC algorithm achieves accurate classification performance using small number of predictive genes when tested using both datasets and compared to previously suggested methods.
This shows that mRMR-ABC is a promising approach for solving gene selection and cancer classification problems.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Alshamlan, Hala& Badr, Ghada& Alohali, Yousef. 2015. mRMR-ABC: A Hybrid Gene Selection Algorithm for Cancer Classification Using Microarray Gene Expression Profiling. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056093
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Alshamlan, Hala…[et al.]. mRMR-ABC: A Hybrid Gene Selection Algorithm for Cancer Classification Using Microarray Gene Expression Profiling. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056093
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Alshamlan, Hala& Badr, Ghada& Alohali, Yousef. mRMR-ABC: A Hybrid Gene Selection Algorithm for Cancer Classification Using Microarray Gene Expression Profiling. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-15.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056093
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056093
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر