Computational Selection of RNA Aptamer against Angiopoietin-2 and Experimental Evaluation
المؤلفون المشاركون
Hu, Wen-Pin
Kumar, Jangam Vikram
Huang, Chun-Jen
Chen, Wen-Yih
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-03-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Angiogenesis plays a decisive role in the growth and spread of cancer and angiopoietin-2 (Ang2) is in the spotlight of studies for its unique role in modulating angiogenesis.
The aim of this study was to introduce a computational simulation approach to screen aptamers with high binding ability for Ang2.
We carried out computational simulations of aptamer-protein interactions by using ZDOCK and ZRANK functions in Discovery Studio 3.5 starting from the available information of aptamers generated through the systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) in the literature.
From the best of three aptamers on the basis of ZRANK scores, 189 sequences with two-point mutations were created and simulated with Ang2.
Then, we used a surface plasmon resonance (SPR) biosensor to test 3 mutant sequences of high ZRANK scores along with a high and a low affinity binding sequence as reported in the literature.
We found a selected RNA aptamer has a higher binding affinity and SPR response than a reported sequence with the highest affinity.
This is the first study of in silico selection of aptamers against Ang2 by using the ZRANK scoring function, which should help to increase the efficiency of selecting aptamers with high target-binding ability.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hu, Wen-Pin& Kumar, Jangam Vikram& Huang, Chun-Jen& Chen, Wen-Yih. 2015. Computational Selection of RNA Aptamer against Angiopoietin-2 and Experimental Evaluation. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056319
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hu, Wen-Pin…[et al.]. Computational Selection of RNA Aptamer against Angiopoietin-2 and Experimental Evaluation. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056319
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hu, Wen-Pin& Kumar, Jangam Vikram& Huang, Chun-Jen& Chen, Wen-Yih. Computational Selection of RNA Aptamer against Angiopoietin-2 and Experimental Evaluation. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056319
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056319
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر