Predicting Long Noncoding RNA and Protein Interactions Using Heterogeneous Network Model
المؤلفون المشاركون
Li, Ao
Wang, Minghui
Ge, Mengqu
Zhang, Yao
Peng, Chen
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-12-29
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Recent study shows that long noncoding RNAs (lncRNAs) are participating in diverse biological processes and complex diseases.
However, at present the functions of lncRNAs are still rarely known.
In this study, we propose a network-based computational method, which is called lncRNA-protein interaction prediction based on Heterogeneous Network Model (LPIHN), to predict the potential lncRNA-protein interactions.
First, we construct a heterogeneous network by integrating the lncRNA-lncRNA similarity network, lncRNA-protein interaction network, and protein-protein interaction (PPI) network.
Then, a random walk with restart is implemented on the heterogeneous network to infer novel lncRNA-protein interactions.
The leave-one-out cross validation test shows that our approach can achieve an AUC value of 96.0%.
Some lncRNA-protein interactions predicted by our method have been confirmed in recent research or database, indicating the efficiency of LPIHN to predict novel lncRNA-protein interactions.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Ao& Ge, Mengqu& Zhang, Yao& Peng, Chen& Wang, Minghui. 2015. Predicting Long Noncoding RNA and Protein Interactions Using Heterogeneous Network Model. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056333
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Ao…[et al.]. Predicting Long Noncoding RNA and Protein Interactions Using Heterogeneous Network Model. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056333
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Ao& Ge, Mengqu& Zhang, Yao& Peng, Chen& Wang, Minghui. Predicting Long Noncoding RNA and Protein Interactions Using Heterogeneous Network Model. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056333
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056333
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر