Shaped Singular Spectrum Analysis for Quantifying Gene Expression, with Application to the Early Drosophila Embryo
المؤلفون المشاركون
Spirov, Alexander V.
Shlemov, Alex
Golyandina, Nina
Holloway, David M.
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-03-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
In recent years, with the development of automated microscopy technologies, the volume and complexity of image data on gene expression have increased tremendously.
The only way to analyze quantitatively and comprehensively such biological data is by developing and applying new sophisticated mathematical approaches.
Here, we present extensions of 2D singular spectrum analysis (2D-SSA) for application to 2D and 3D datasets of embryo images.
These extensions, circular and shaped 2D-SSA, are applied to gene expression in the nuclear layer just under the surface of the Drosophila (fruit fly) embryo.
We consider the commonly used cylindrical projection of the ellipsoidal Drosophila embryo.
We demonstrate how circular and shaped versions of 2D-SSA help to decompose expression data into identifiable components (such as trend and noise), as well as separating signals from different genes.
Detection and improvement of under- and overcorrection in multichannel imaging is addressed, as well as the extraction and analysis of 3D features in 3D gene expression patterns.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Shlemov, Alex& Golyandina, Nina& Holloway, David M.& Spirov, Alexander V.. 2015. Shaped Singular Spectrum Analysis for Quantifying Gene Expression, with Application to the Early Drosophila Embryo. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056398
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Shlemov, Alex…[et al.]. Shaped Singular Spectrum Analysis for Quantifying Gene Expression, with Application to the Early Drosophila Embryo. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056398
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Shlemov, Alex& Golyandina, Nina& Holloway, David M.& Spirov, Alexander V.. Shaped Singular Spectrum Analysis for Quantifying Gene Expression, with Application to the Early Drosophila Embryo. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056398
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056398
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر