Strong Ligand-Protein Interactions Derived from Diffuse Ligand Interactions with Loose Binding Sites
المؤلف
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-05-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Many systems in biology rely on binding of ligands to target proteins in a single high-affinity conformation with a favorable ΔG.
Alternatively, interactions of ligands with protein regions that allow diffuse binding, distributed over multiple sites and conformations, can exhibit favorable ΔG because of their higher entropy.
Diffuse binding may be biologically important for multidrug transporters and carrier proteins.
A fine-grained computational method for numerical integration of total binding ΔG arising from diffuse regional interaction of a ligand in multiple conformations using a Markov Chain Monte Carlo (MCMC) approach is presented.
This method yields a metric that quantifies the influence on overall ligand affinity of ligand binding to multiple, distinct sites within a protein binding region.
This metric is essentially a measure of dispersion in equilibrium ligand binding and depends on both the number of potential sites of interaction and the distribution of their individual predicted affinities.
Analysis of test cases indicates that, for some ligand/protein pairs involving transporters and carrier proteins, diffuse binding contributes greatly to total affinity, whereas in other cases the influence is modest.
This approach may be useful for studying situations where “nonspecific” interactions contribute to biological function.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Marsh, Lorraine. 2015. Strong Ligand-Protein Interactions Derived from Diffuse Ligand Interactions with Loose Binding Sites. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056601
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Marsh, Lorraine. Strong Ligand-Protein Interactions Derived from Diffuse Ligand Interactions with Loose Binding Sites. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056601
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Marsh, Lorraine. Strong Ligand-Protein Interactions Derived from Diffuse Ligand Interactions with Loose Binding Sites. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1056601
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1056601
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر