RNAseq by Total RNA Library Identifies Additional RNAs Compared to Poly(A) RNA Library
المؤلفون المشاركون
Shyr, Yu
Sheng, Quanhu
Lehmann, Brian
Pietenpol, Jennifer
Guo, Mingsheng
Samuels, David C.
Guo, Yan
Zhao, Shilin
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-10-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The most popular RNA library used for RNA sequencing is the poly(A) captured RNA library.
This library captures RNA based on the presence of poly(A) tails at the 3′ end.
Another type of RNA library for RNA sequencing is the total RNA library which differs from the poly(A) library by capture method and price.
The total RNA library costs more and its capture of RNA is not dependent on the presence of poly(A) tails.
In practice, only ribosomal RNAs and small RNAs are washed out in the total RNA library preparation.
To evaluate the ability of detecting RNA for both RNA libraries we designed a study using RNA sequencing data of the same two breast cancer cell lines from both RNA libraries.
We found that the RNA expression values captured by both RNA libraries were highly correlated.
However, the number of RNAs captured was significantly higher for the total RNA library.
Furthermore, we identify several subsets of protein coding RNAs that were not captured efficiently by the poly(A) library.
One of the most noticeable is the histone-encode genes, which lack the poly(A) tail.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Guo, Yan& Zhao, Shilin& Sheng, Quanhu& Guo, Mingsheng& Lehmann, Brian& Pietenpol, Jennifer…[et al.]. 2015. RNAseq by Total RNA Library Identifies Additional RNAs Compared to Poly(A) RNA Library. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057051
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Guo, Yan…[et al.]. RNAseq by Total RNA Library Identifies Additional RNAs Compared to Poly(A) RNA Library. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057051
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Guo, Yan& Zhao, Shilin& Sheng, Quanhu& Guo, Mingsheng& Lehmann, Brian& Pietenpol, Jennifer…[et al.]. RNAseq by Total RNA Library Identifies Additional RNAs Compared to Poly(A) RNA Library. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057051
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1057051
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر