Combined Analysis of SNP Array Data Identifies Novel CNV Candidates and Pathways in Ependymoma and Mesothelioma
المؤلفون المشاركون
Wajnberg, Gabriel
Carvalho, Benilton S.
Ferreira, Carlos G.
Passetti, Fabio
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-06-22
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Copy number variation is a class of structural genomic modifications that includes the gain and loss of a specific genomic region, which may include an entire gene.
Many studies have used low-resolution techniques to identify regions that are frequently lost or amplified in cancer.
Usually, researchers choose to use proprietary or non-open-source software to detect these regions because the graphical interface tends to be easier to use.
In this study, we combined two different open-source packages into an innovative strategy to identify novel copy number variations and pathways associated with cancer.
We used a mesothelioma and ependymoma published datasets to assess our tool.
We detected previously described and novel copy number variations that are associated with cancer chemotherapy resistance.
We also identified altered pathways associated with these diseases, like cell adhesion in patients with mesothelioma and negative regulation of glutamatergic synaptic transmission in ependymoma patients.
In conclusion, we present a novel strategy using open-source software to identify copy number variations and altered pathways associated with cancer.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wajnberg, Gabriel& Carvalho, Benilton S.& Ferreira, Carlos G.& Passetti, Fabio. 2015. Combined Analysis of SNP Array Data Identifies Novel CNV Candidates and Pathways in Ependymoma and Mesothelioma. BioMed Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057170
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wajnberg, Gabriel…[et al.]. Combined Analysis of SNP Array Data Identifies Novel CNV Candidates and Pathways in Ependymoma and Mesothelioma. BioMed Research International No. 2015 (2015), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057170
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wajnberg, Gabriel& Carvalho, Benilton S.& Ferreira, Carlos G.& Passetti, Fabio. Combined Analysis of SNP Array Data Identifies Novel CNV Candidates and Pathways in Ependymoma and Mesothelioma. BioMed Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057170
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1057170
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر